基于16S rRNA测序揭示中国不同年龄段人群粪便微生物组与长寿相关的标志物

【字体: 时间:2026年02月25日 来源:Applied Microbiology and Biotechnology 4.3

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  本研究通过分析中国三个年龄段(≥90岁、60-89岁、45-59岁)人群的粪便样本,利用16S rRNA测序技术揭示了长寿个体的肠道微生物组成特征,发现其微生物多样性更高,且富含与健康长寿相关的特定菌群(如拟杆菌门、嗜黏蛋白阿克曼菌)及代谢通路。研究不仅为理解肠道菌群在健康衰老中的作用提供了新视角,还建立了基于qPCR检测和逻辑回归的分类模型,为长寿预测和抗衰老干预靶点的开发提供了潜在工具。

  
论文解读
随着社会步入老龄化,如何实现健康、高质量的长寿已成为全球性的挑战。国家统计局数据显示,中国的老龄化进程在加剧,但人均健康预期寿命与人均预期寿命之间存在约8年的差距,这意味着许多老年人需要带病生存,为家庭和社会带来了沉重的照护负担。因此,探寻健康的决定因素并开发针对性干预策略,对于促进健康老龄化至关重要。其中,肠道微生物群作为人体最复杂的微生态系统之一,被认为是调控衰老与寿命的关键“开关”。研究表明,肠道菌群不仅影响消化吸收,更与心血管、免疫、神经等多种系统性疾病息息相关。那么,长寿老人(例如90岁以上)的肠道里是否蕴藏着健康的“密码”?与普通老年人相比,他们的肠道菌群有何独到之处?这些差异又通过哪些生物学途径影响着生命质量与长度?这些问题正是研究者们探索的方向。
为了回答上述问题,研究人员在中国浙江省开化县(一个被国际自然医学会认证的“世界长寿乡”)展开了一项研究。他们收集了301名无重大疾病成年人的粪便样本,按年龄分为三组:长寿组(≥90岁,103人)、老年组(60–89岁,100人)和年轻组(45–59岁,98人)。随后,研究人员利用16S rRNA测序技术,对这些样本的微生物组成进行了全景式分析,并进一步运用PICRUSt2进行了功能预测,以探究其潜在的代谢通路差异。为了将发现转化为可应用的工具,研究团队还开发了定量聚合酶链式反应(qPCR)检测方法,并构建了逻辑回归分类模型,以期能够区分不同的年龄组别。相关成果发表在国际期刊《Applied Microbiology and Biotechnology》上。
【主要研究方法】
本研究主要采用的技术方法包括:1. 16S rRNA基因测序:对301份粪便样本进行测序,随后进行质量过滤、去噪、去嵌合体等生物信息学分析,以评估微生物群落组成和α、β多样性。2. 微生物功能预测:使用PICRUSt2工具,基于测序获得的扩增子序列变异(ASV)数据,预测微生物群落的功能潜能,并通过BugBase进行表型预测。3. 定量PCR (qPCR)验证:设计并合成了针对5个差异属的属特异性引物,通过qPCR技术对测序结果进行验证。4. 统计分析与建模:使用R软件进行非参数检验,并利用qPCR所得的ΔCt值构建多元逻辑回归模型,以区分长寿组与其他年龄组,并计算模型的灵敏度、特异度和曲线下面积(AUC)。
【研究结果】
不同年龄组肠道微生物组成的差异
分析结果显示,长寿组个体的肠道微生物多样性显著高于老年组,而与年轻组无显著差异。在门水平上,Firmicutes(厚壁菌门)、Bacteroidota(拟杆菌门)和Proteobacteria(变形菌门)是三个最丰富的门。其中,Bacteroidota在长寿组和年轻组中的相对丰度均显著高于老年组。在属水平上,与老年组相比,长寿组的Klebsiella(克雷伯菌属)、Akkermansia(阿克曼菌属)和UCG-002的相对丰度显著更高,而Prevotella_9(普雷沃菌属9)、Megamonas(巨单胞菌属)和Agathobacter(阿加托杆菌属)的丰度则更低。
不同年龄组肠道微生物功能的差异
功能预测分析表明,与老年组相比,长寿组的肠道菌群在多个KEGG Level 3通路上显著富集,包括:不饱和脂肪酸的生物合成;丙酮酸代谢;酮体的合成与降解;缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸的降解;以及色氨酸代谢。相反,长寿组在烟酸和烟酰胺代谢以及幽门螺杆菌感染中的上皮细胞信号通路等途径上的富集度则明显降低。此外,BugBase的微生物表型预测显示,老年组中潜在病原微生物的丰度显著高于长寿组和年轻组。
基于qPCR的长寿相关微生物检测方法的开发
基于比较分析的结果,研究团队选择了5个差异属(Alistipes, Akkermansia, Klebsiella, Megamonas, Prevotella)进行qPCR验证。结果证实,长寿组中AlistipesAkkermansiaKlebsiella的相对丰度显著高于老年组和年轻组。这一发现与16S rRNA测序数据基本一致。
多元逻辑回归分类模型的构建
研究团队利用qPCR检测到的4个属(Akkermansia, Klebsiella, Megamonas, Prevotella)的相对丰度(以ΔCt值表示)构建了二元逻辑回归模型。该模型能够有效区分长寿组与老年组,其灵敏度为82.0%,特异度为76.0%,受试者工作特征曲线下面积(AUC)达到0.853。使用3个属(Akkermansia, Klebsiella, Prevotella)构建的模型则能够区分长寿组与年轻组(AUC=0.812)。
【结论与讨论】
本研究证实,长寿个体拥有比普通老年人更为多样化、且与年轻人水平相当的肠道菌群。其菌群特征表现为 BacteroidotaAkkermansia的相对丰度显著增加,而 Prevotella_9Megamonas则减少。文中深入探讨了这些差异的潜在意义:例如,Akkermansia muciniphila(嗜黏蛋白阿克曼菌)被认为是一种具有多种益处的微生物,能够通过刺激黏液分泌、增强肠道屏障完整性、调节免疫反应以及产生短链脂肪酸等方式,对抗炎症和代谢紊乱,从而可能促进长寿。功能分析进一步揭示了长寿组肠道菌群在代谢通路上的独特之处,特别是在不饱和脂肪酸、酮体和色氨酸代谢途径上的富集。已有研究表明,不饱和脂肪酸有助于延长寿命,而酮体除了作为能量来源外,还可能通过促进线粒体自噬等方式发挥抗衰老作用。色氨酸代谢产物(如5-甲氧基吲哚乙酸)也被发现与长寿和减少炎症相关。
更重要的是,该研究不仅停留在描述性关联分析上,还向前迈出了转化应用的关键一步。通过建立基于qPCR的检测方法和分类模型,研究为未来开发预测健康衰老状态或评估长寿潜力的非侵入性诊断工具奠定了基础。尽管这是一个横断面研究,无法确立因果关系,但它系统性地描绘了长寿相关的肠道微生物组“蓝图”,并提供了可操作的技术路径。这项研究揭示了肠道微生物组在健康衰老中的关键作用,其发现的特定菌属和代谢通路为未来开发益生菌、益生元或粪菌移植等靶向干预策略提供了科学依据,有望助力实现从“活得久”到“活得好”的健康老龄化目标。
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