鸡盲肠黏膜中的微生物群组成与盲肠腔内的微生物群存在显著差异

《Animal Microbiome》：Composition of microbiota from chicken caecal mucosa considerably differs from microbiota in the caecal lumen

鸡盲肠黏膜与腔内菌群组成及功能差异研究，发现黏膜相关菌群包含螺旋体属、Brachyspira innocens等具有趋化性和运动性的细菌，能通过type VI分泌系统影响宿主行为，而Bacteroidota富集于腔内，碳水化合物和氨基酸发酵分工明确。

　　

摘要

背景

尽管肠道黏膜表面的微生物群具有重要意义，并且其组成与肠道腔内的微生物群有所不同，但专门研究这一主题的论文却寥寥无几。因此，在本研究中，我们定义了来自鸡盲肠的黏膜相关微生物群和腔内相关微生物群。

结果

为了识别适应黏膜环境的微生物群成员，应该分析成年母鸡的盲肠而非雏鸡的盲肠。适应黏膜环境的微生物群包括类似Treponema的物种、Brachyspira innocens、Mucispirillum属菌、Helicobacter pullorum、Desulfovibrio属菌以及Anaerobiospirillum属菌。另一方面，拟杆菌门（Bacteroidota）的菌株在盲肠腔内较为丰富。一周龄雏鸡的黏膜表面定植情况较差，这是由于孵化场提供的雏鸡缺乏适当的微生物群来源；当这些雏鸡在成年母鸡的陪伴下饲养时，它们在出生后的第一周内就能被适应黏膜环境的微生物群有效定植。所鉴定出的黏膜相关细菌呈螺旋状，具有趋化性和运动能力，并且在体内表达VI型分泌系统。Brachyspira innocens和Anaerobiospirillum能够发酵碳水化合物，而Mucispirillum属菌和Helicobacter pullorum则偏好氨基酸发酵。

结论

我们在这里定义了鸡盲肠的黏膜微生物群，这类微生物群与鸡宿主的接触更为紧密，因此可能显著影响鸡的行为。