囊性变型的腺瘤样牙源性肿瘤缺乏腺瘤样牙源性肿瘤中常见的TP53和IDH2突变：一项初步的下一代测序分析

《Journal of Maxillofacial and Oral Surgery》：Cystic Variant of Adenomatoid Odontogenic Tumor Lacks Novel TP53 and IDH2 Mutations of Adenomatoid Odontogenic Tumor: A Preliminary Next-Generation Sequencing Analysis

腺omatoid odontogenic tumor (AOT)的50-gene NGS分析显示传统AOT存在TP53（c.841G>A/p.Asp281Asn）、KRAS（chr12:25378651 T>C）和IDH2（chr15:90631838 C>T）等致病突变，提示真性肿瘤；而囊性变体未检出这些突变，可能非肿瘤或由其他基因驱动。

摘要

目的

通过50基因组下一代测序（NGS）技术研究传统性腺瘤样牙源性肿瘤（Conventional Adenomatoid Odontogenic Tumor, AOT）的分子特征，并将其与所谓的“囊性腺瘤样牙源性肿瘤”（Cystic Variant of Adenomatoid Odontogenic Tumor）的突变进行比较。

方法

在获得机构伦理委员会的批准后，对3例传统性AOT病例和2例报告的囊性AOT病例进行了50基因组下一代测序分析。变异基因的注释和筛选使用了GENEYX（版本6.1）分析工作流程，该流程遵循了美国医学遗传学和基因组学学院（ACMG）、美国分子病理学协会（AMP）以及美国病理学家学院（CAP）的指导原则。

结果

传统性AOT病例显示TP53基因第8外显子存在导致功能丧失的错义突变，具体表现为c.841G > A（p.Asp281Asn）；第5外显子也存在类似的突变，表现为c.476C > T（p.Ala159Val）。其他显著突变包括KRAS基因第4外显子（chr12:25378651，T > C）和IDH2基因第4外显子（chr15:90631838，C > T）的错义突变。而囊性AOT病例则未检测到这些致病性突变。

结论

传统性AOT的特点是KRAS、TP53和IDH2基因存在错义突变，这表明其具有真正的肿瘤性质而非错构瘤病变。此外，通过50基因组下一代测序发现囊性AOT中缺乏这些突变，提示该病变可能属于非肿瘤性病变，或者由当前测序面板未覆盖的其他基因驱动。