?平当树基因组获解析

　　 　

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平当树（Paradombeya sinensis）是我国西南干热河谷特有的国家二级重点保护野生植物，特产云南省和四川省怒江、金沙江等流域，具有极强的耐旱能力，在生态修复和园林观赏方面潜力突出。

近日，中国科学院昆明植物研究所云南省极小种群野生植物综合保护重点实验室研究团队综合运用PacBio HiFi、Oxford Nanopore、Hi-C等多种测序技术，获得了无间隙的染色体级别参考基因组，并解析了其叶绿体与线粒体基因组特征。此次组装的基因组总长约890 Mb，注释到68,639个基因，完整度高达99.93%。这一高质量基因组将用于解决平当树属与其近缘属的分类争议，并为保护单元划分、迁地保护效果评估、抗旱基因挖掘及生态修复示范项目提供重要支撑，为该物种的保护遗传学、系统发育地位确立及可持续利用奠定了关键基础。同时，平当树枝条优雅、花序洁白，具备园艺开发价值，基因组资源也将推动其优良品种的选育与应用。

基于本研究结果，团队在国际期刊Scientific Data在线发表了题为A haplotype-resolved gap-free chromosome assembly of the threatened plant?Paradombeya sinensis的研究论文，团队博士研究生陶丽丹为第一作者，孙卫邦研究员为通讯作者，昆明植物园唐凌云工程师以及团队硕士研究生陈俞荧为本文其余作者。本研究获得云南省重点研发计划项目“西南山地河谷生物多样性保护及生态屏障建设研究”（202403AC100028）和国家重点研发计划项目“植物园迁地保护与种质资源保存关键技术”课题二（2024YFF1307402）的资助。

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