年轻女性胃癌患者的分子特征、潜在机制及预后基因模型

《Cancer Reports》：Molecular Characteristics, Potential Mechanisms, and Prognostic Gene Model of Younger Female Patients With Gastric Cancer

本研究通过分析GEO数据库中年轻女性胃癌患者与癌旁组织的基因表达数据，结合GO、KEGG和GSEA分析，发现年轻女性胃癌患者存在显著的雌激素响应通路富集，以及醛固酮和松弛素信号通路富集于年轻组。通过Lasso-Cox回归筛选出NREP、GAD1、SLCO4A1、KRT17、DEFB1和P3H2六个预后相关基因，构建的预后模型在生存分析中AUC为0.810，且年轻女性患者处于高风险组的比例显著高于老年女性患者（31.1% vs 18.3%, p<0.018），高风险患者总生存期显著缩短（HR=5.7688, 95%CI: 3.0108-11.0530）。

　　

摘要

背景

与女性相比，男性患者患胃癌（GC）的概率是女性的两倍，这部分是由于雌激素的保护作用。然而，在年轻的胃癌患者中，女性的比例有所增加。

研究目的

本研究旨在探索年轻女性胃癌患者的全面分子特征，并开发一个用于预测女性胃癌患者预后的基因模型。

材料与方法

从Gene Expression Omnibus (GEO)数据库中下载了胃癌患者和非肿瘤患者的基因表达数据及临床信息。利用Gene Ontology (GO)、Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG)和基因集富集分析（GSEA）来发现年轻女性胃癌患者的分子特征和潜在机制。通过Lasso–Cox回归建立了一个包含六个差异表达基因（DEGs）的预后基因模型，这些基因在年轻患者和老年患者之间存在差异。该模型的性能通过外部验证得到了验证。随后，使用接收者操作特征（ROC）曲线来确定该预后基因模型的预测价值。

结果

研究纳入了6个GEO队列，包括305名年轻女性胃癌患者（69名）和236名老年胃癌患者，以及38名女性非肿瘤患者。共鉴定出4557个在女性胃癌患者和非肿瘤患者之间差异表达的基因，其中2212个基因上调，2345个基因下调。在年轻女性胃癌患者中，雌激素早期反应（p<0.001）和雌激素晚期反应（p<0.001）相关基因富集。KEGG分析显示，醛固酮（p=0.023）和松弛素（p=0.043）通路在年轻组中更为显著。此外，我们进一步使用GSE84437队列构建了一个包含六个基因（NREP、GAD1、SLCO4A1、KRT17、DEFB1和P3H2）的预后基因模型，用于预测女性胃癌患者的总生存期（OS），其AUC值为0.810。在所有女性胃癌患者的总体分析中，高风险患者的生存期明显低于低风险患者（HR=5.7688，95% CI: 3.0108–11.0530，p<0.001）。与老年女性患者相比，年轻女性患者更倾向于属于高风险组（31.1% vs. 18.3%，p=0.018）。

结论

综上所述，我们提供了年轻女性胃癌患者的全面分子特征，并发现年轻组和老年组在激素相关通路方面存在显著差异。与老年女性患者相比，年轻女性患者更可能属于高风险组，且其生存期更差。

利益冲突

作者声明没有利益冲突。

数据可用性声明

本研究中分析的公共数据集可以在GSE数据库中找到（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/）。