基于BSA-seq技术定位玉米籽粒花青素关联基因

　　

摘要： 花青素作为鲜食玉米的表型之一，使其具有更高的营养价值和经济价值。为了研究玉米籽粒中花青素的关联基因，本研究利用连续自交多代的黑糯和白糯玉米作为亲本材料构建获得F₂代分离群体。于F_2:3统计玉米籽粒颜色表明，黑白粒占比表现为极显著差异。利用BSA-seq技术对黑粒和白粒的表型混池样本进行基因组测序，挖掘花青素积累的关联基因。通过表型和基因测序联合分析，玉米籽粒中花青素合成的关联基因片段主要位于第6号染色体的107.9 ~113.2 Mb区域内。候选区域内共注释到116个基因，其中包括53个非同义突变基因，17个移码突变基因。通过基因注释信息分析，推测出花青素结构基因Zm00001eb276450 (ANR)，转录因子基因Zm00001eb276870 (WD40)和Zm00001eb276640 (MYB)可能为玉米籽粒中花青素关联的候选基因。该研究结果为进一步完善玉米籽粒花青素关联基因的功能解析奠定重要的基础，也为快速筛选花青素鲜食玉米新品种提供参考基因。