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鞘翅目金龟总科物种丰富多样，但基因组数据稀缺，阻碍了其进化研究。为此，研究人员针对Lethrus scoparius和L. apterus开展了基因组测序与组装。结果获得了L. scoparius的2,873个contigs (N50=301,243 bp) 和L. apterus的886个scaffolds (N50=1,378,308 bp)，BUSCO完整性分别达98.1%和96.8%，并注释了超过1.5万个基因。这些高质量的基因组草图为理解金龟总科的进化提供了关键数据。
在昆虫纲庞大的家族中，鞘翅目（Coleoptera）是物种最丰富的类群，而金龟总科（Scarabaeoidea）又是其中的一个物种多样、行为各异且生态意义重大的超级家族。从著名的蜣螂（俗称屎壳郎）到威武的犀金龟，这个家族的成员在分解有机物、传播种子乃至文化交流（如古埃及对圣甲虫的崇拜）中都扮演着关键角色。它们取食和交配行为的多样性，一直是生物学家津津乐道的研究课题。然而，尽管种类繁多、引人注目，科学界对它们演化历程的基因组基础却知之甚少。与鸟类、哺乳动物甚至其他昆虫目相比，已公开发表的金龟总科基因组数量寥寥无几，这构成了理解该类群基因组结构、功能基因进化以及独特性状形成机制的巨大空白。
为了填补这一知识鸿沟，一项研究聚焦于金龟总科下的Lethrus属，旨在为这个超级家族的进化拼图补上关键的两块。研究人员选择了Lethrus scoparius和Lethrus apterus两个物种作为突破口。对于L. scoparius，研究目标是构建其首个基因组草图；而对于已有初步组装数据的L. apterus，目标则是利用更先进的技术提升其基因组组装的质量。这项工作的成果最终以数据描述的形式，发表在专注于共享科学数据的期刊《Scientific Data》上。
研究人员主要运用了第三代测序技术来生成长读长序列数据，这是获得高质量基因组组装的关键。基于这些数据，他们进行了基因组的从头组装（de novo assembly），获得了contig（重叠群）和scaffold（脚手架）序列。组装质量通过N50（衡量组装连续性的指标，数值越高表示组装出的长片段越好）和BUSCO（Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs，用于评估基因组组装完整性的工具）分析进行严格评估。随后，他们对组装好的基因组进行了基因预测和功能注释，为后续的比较基因组学和功能进化研究奠定了基础。
基因组组装与质量评估
通过对L. scoparius的测序数据进行组装，研究人员成功构建了该物种的首个基因组草图。该基因组由2,873个contigs构成，其N50值达到301,243 bp，显示出良好的连续性。BUSCO分析结果更为亮眼，在利用Endopterygota（完全变态类昆虫）直系同源基因数据库进行评估时，获得了高达98.1%的完整直系同源基因检出率，证明该基因组组装在基因区域具有极高的完整性。对于L. apterus，研究则显著提升了其基因组组装水平。最终的组装结果包含886个scaffolds，N50值高达1,378,308 bp，连续性是L. scoparius基因组的数倍。其BUSCO完整度也达到了96.8%，表明这也是一个高度完整的基因组版本。
基因注释
在获得高质量的基因组组装后，研究团队对其中的蛋白质编码基因进行了预测和功能注释。在L. scoparius基因组中，共有15,252个基因被成功预测并赋予了可能的功能信息。而在组装质量更高的L. apterus基因组中，这一数字略高，为15,520个。这些被注释的基因构成了后续研究这两个物种，乃至整个金龟总科基因功能、代谢通路和进化历史的宝贵资源。
该研究成功完成了对Lethrus scoparius和Lethrus apterus的基因组草图构建与注释，前者为首个基因组，后者则在连续性上获得大幅提升。两个基因组的BUSCO完整度均超过96%，验证了其作为可靠研究数据的价值。这项工作首次为Lethrus属提供了高质量的基因组资源，更重要的是，它为庞大的金龟总科增添了两个关键的基因组代表。在讨论中，作者强调了这些基因组数据对于未来研究的意义：它们将成为比较基因组学分析的基石，帮助科学家们解析金龟总科内部复杂的系统发育关系，探究其取食习性（如粪食性、腐食性、植食性）和独特行为（如育幼行为、求偶展示）背后的遗传机制，最终推动对整个鞘翅目乃至昆虫纲适应性进化规律的更深层次理解。发表于《Scientific Data》确保了数据的可及性与可重复性，鼓励全球研究者共同挖掘这些数据的潜力。
