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研究表明,进化分化发生在生态分化之前,这使得这些昆虫能够同时以木材和土壤为食。未来的发现或可应用于生物燃料的生产。
决定基因的并非总是生态条件,而是那些使同一类动物能够占据不同生态位(例如树干和底土)的基因。迄今为止规模最大的白蚁基因组测序项目分析了47种昆虫,初步结果发表
在《自然通讯》 杂志上 。
分析表明,在白蚁分化为以木材为食和以土壤为食的种类之前,其基因组就已经发生了扩张。后来,新基因和转座元件(一种可以在基因组中改变位置并执行不同功能的DNA序列)的加入,使得白蚁能够发展出不同的取食习性。
“进化上的分化发生在生态分化之前。当白蚁开始探索环境时,它们拥有非常广泛的基因框架,其中包含许多负责消化纤维素和半纤维素等复杂碳水化合物的基因,” 巴西圣保罗州圣安德烈市ABC联邦大学自然与人文科学中心(CCNH-UFABC)的教授
伊夫斯·海菲格(Ives Haifig )说道。海菲格是这项研究中唯一的巴西籍合著者。
白蚁能够消化纤维素、半纤维素和木质素,这使得它们在生物技术领域具有很高的研究价值。未来的研究成果或许可以应用于生物燃料的生产等领域。
海菲格解释说,这项研究是白蚁基因组系列研究中的第一项,其主要目的是为更深入的分析提供必要的工具。未来的研究将分析基因组与社会行为和免疫力等方面的关系。
“此前,我们只有来自九种白蚁的短序列基因组。在这项研究中,我们对45种白蚁的长片段基因组进行了测序,这些物种约占目前已描述白蚁科物种多样性的80%(目前已描述白蚁科物种约有3000种),此外还包括两种蟑螂,它们是白蚁的近亲,”海菲格报告说。
工具箱
研究人员指出,基因组本身并不能揭示基因的具体功能,只能揭示其遗传潜能。要了解这些基因如何运作,需要进行转录组学研究,以确定基因正在转录哪些内容,并开展功能实验。“这就像我们现在拥有了一整套工具,而以前我们只有一两样工具,”研究人员说道。
海菲格实验室研究的物种之一是 太平洋无刺白蚁(Anoplotermes pacificus),该物种的基因组序列已用于最近发表的研究。“这是一个特别有趣的物种,因为它没有兵蚁阶层,而兵蚁阶层通常负责保卫蚁群。这项研究的基因组数据告诉我们哪些是可能的,而实验则告诉我们实际发生了什么,”他解释道。
白蚁最早出现在化石记录中是在早白垩世,距今约1.3亿年前。白蚁科(Termitidae)的物种多样性最高,该科起源于始新世,距今约5000万年前,并在大约3000万年前开始多样化。白蚁科约占现存白蚁物种的80%,因此也是大多数研究的重点。
虽然其他12个科主要依靠生活在其消化系统中的原生动物以木材为食,但白蚁科已经失去了鞭毛虫共生体,转而以分解梯度中的各种有机物为食。这些有机物包括木材、生活在木材中的微型附生生物、腐烂的木材、腐殖质、土壤和真菌。
“这项研究证明基因组扩张发生在摄食习性多样化之前,从而改变了我们对白蚁进化的理解。这项研究不仅回答了一个具体问题,更开启了白蚁研究的新阶段,它提供了高质量的基因组,这些基因组将为未来研究白蚁的社会行为、免疫力以及促成其进化成功的生态适应性奠定基础。”研究人员总结道。
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