利用LIBS技术分析指甲生物标志物,实现基于人工智能的慢性肾脏病非侵入性诊断

【字体: 时间:2026年03月10日 来源:Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy 4.3

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  CKD非侵入式诊断研究通过LIBS光谱分析与XGBoost机器学习结合,利用指甲作为生物标志物,实现97%的准确率,并通过外部验证证明模型的可扩展性。

  
伊姆兰·雷汉|穆罕默德·阿米尔
物理系,伊斯兰大学,白沙瓦,开伯尔-普赫图赫瓦省 25120,巴基斯坦

摘要

慢性肾病(CKD)是一种系统性疾病,会导致进行性肾衰竭和代谢失衡,这些变化可能出现在身体的角质化生物组织中,如指甲。然而,由于当前临床筛查方法的侵入性,早期检测仍然很困难。本文提出了一种精确、无创且基于人工智能(AI)的CKD筛查模型,该模型结合了激光诱导击穿光谱(LIBS)和先进的集成机器学习技术来分析指甲生物标志物的元素特征。在本研究中,55名慢性肾病患者和45名健康对照组作为研究对象,使用波长为1064纳米的激光和纳秒级LIBS光谱仪测量了他们的发射光谱。为了处理高维光谱数据,采用了主成分分析(PCA)作为特征提取方法,为新型机器学习模型奠定了基础。特别应用了极端梯度提升(XGBoost)集成学习算法来分析CKD样本与对照组样本之间的生化差异,并通过与支持向量机(SVM)算法的相对比较来测试其预测能力。通过10折交叉验证,XGBoost模型的准确率为97%,灵敏度为98%,精确度为96%,F1分数为97%。此外,在另一个独立数据集上的外部验证表明,该模型具有鲁棒性和泛化能力,准确率为95%,灵敏度为97%,F1分数为95%。研究结果表明,结合LIBS和集成机器学习的指甲检测方法是一种有潜力的无创CKD分类工具。

引言

激光诱导击穿光谱(LIBS)是一种适用于多种分析的高效技术。该技术涉及将高功率、短时间的激光脉冲聚焦在待测材料表面[1]。当激光功率超过击穿阈值时,会发生光学击穿,产生高度电离的气体(等离子体)。
等离子体冷却后,会释放出其组成粒子(原子、离子和分子)的特征发射峰。只要假设等离子体真实反映了样品的原始成分,就可以通过分析光谱特征来确定样品中含有的元素[2]、[3]。由于几乎不需要样品预处理、数据采集速度快以及对广泛元素具有高灵敏度,LIBS在生物医学研究中受到了越来越多的关注。它已被广泛用于分析生物材料,并被用来研究细菌以及骨骼、牙齿、头发和指甲等硬质和角质化组织,显示出其广泛的诊断潜力[4]、[5]。慢性肾病是一种肾脏功能逐渐下降的疾病,会逐渐降低肾脏清除代谢废物以及调节体液和电解质平衡的能力。有效的疾病管理依赖于早期和正确的CKD分期,这通常通过常规的实验室临床检查来确定[6]。
临床上,当出现肾脏损伤或肾功能下降的证据时,即可诊断出这种疾病。这种功能下降具体表现为肾小球滤过率(GFR)低于每1.73平方米60毫升/分钟,并持续三个月或更长时间[7]。根据流行病学研究,全球约有10%的人口患有CKD,目前已有超过8亿人被诊断出患有此病,且这一数字每年都在增长,预计到2040年该疾病将成为全球主要的死亡原因,因此迫切需要采用更好的诊断方法[8]。尽管CKD的确切原因尚不清楚,但糖尿病、高血压、心血管疾病、肾小球肾炎、老年和肥胖等几个因素被认为是主要的风险因素[9]、[10]、[11]、[12]。
头发、骨骼、牙齿和指甲等生物组织含有长期的生理和代谢标志物,分析这些基质中的微量和有毒金属含量可以通过元素分析提供有力的健康评估方法[13]。已知肾脏功能障碍和钙化组织的变化与高钙尿症、骨质疏松症和骨矿物质密度降低密切相关[14]。
肾脏通过调节血液中的钙、磷、铁等重要矿物质来维持矿物质平衡,这对钙化和角质化组织的结构完整性至关重要。异常的矿物质积累和元素失衡可能是由肾脏功能障碍引起的,这通常与激素失衡有关,进而影响头发和指甲等生物组织。
目前,流行病学和生物医学科学家已经定义了许多基于组织的生物标志物,这些标志物可以指示由慢性疾病引起的长期代谢和病理变化。与其他标准临床指标一样,指甲也有潜力作为元素生物标志物,因为它们能够捕获累积的生化数据,并反映与CKD相关的系统性矿物质失衡。指甲样本的优点在于采集无创、化学稳定性高,且可在室温下储存,这使它们非常适合大规模健康研究、疾病监测,特别是在资源有限的环境中。指甲的生化和元素复杂性提供了关于生理和病理过程的重要信息,因为其分层的角蛋白结构记录了指甲形成过程中的生物过程[15]。典型的诊断技术如原子吸收光谱(AAS)、电感耦合等离子体质谱/光学发射光谱(ICP-MS/OES)和傅里叶变换红外(FTIR)光谱是最常用的分析指甲元素组成和研究疾病相关变化的方法[16]、[17]、[18]、[19]。
尽管这些方法具有分析精度高,但通常需要大量的样品预处理、较高的操作成本和较长的分析时间。相比之下,LIBS提供了一种快速、经济实惠的替代方法,几乎不需要或完全不需要样品预处理,使其适用于实际疾病诊断[20]、[21]。
通常,直接比较健康指甲样本和CKD受影响指甲样本的LIBS光谱并不容易,因为光谱波动微妙且重叠。因此,可靠的区分需要先进的数据驱动分析,而不仅仅是定性的光谱检查。解决这些问题的关键在于结合机器学习。人工智能领域的最新进展,特别是所谓的集成学习和其他机器学习模型,大大提高了光谱方法在复杂生物医学分类任务中的诊断能力[22]、[23]、[24]、[25]、[26]、[27]。分析后,数据的全谱通过统计模型根据峰值强度的变化进行分类。
最近的研究探索了这种整合方法;例如,衰减全反射-傅里叶变换红外(ATR-FTIR)光谱与PCA和PLS-DA结合用于血清基CKD检测[28],而尿表面增强拉曼光谱(SERS)与PCA-SVM结合用于研究常染色体显性多囊肾病(ADPKD)的进展,从而实现了交叉验证的准确性[29]。同样,一项关于肾脏组织的拉曼光谱与SVM/随机森林算法结合的临床前概念研究在小鼠模型中显示出了糖尿病肾病的早期识别的高准确性[30],而类似的结合使用自定义双分支注意力网络(DBAN)也成功用于通过血清分析诊断糖尿病肾病[31]。这些有用的整合方法强调了将先进算法与光谱学结合的机会。然而,尽管有这些发展,将LIBS与集成学习结合用于CKD分类(特别是使用指甲生物标志物)的研究尚未系统地进行。当前的研究通过使用指甲和集成机器学习的无创LIBS诊断模型填补了这一空白。
本文提出了一种无创诊断系统,通过分析指甲的独特LIBS光谱模式来区分CKD患者和健康个体。为了捕捉疾病相关的细微光谱差异,采用了多变量统计学习方法,以确保分类结果基于数据、客观且可重复。指甲采集和储存的简便性使其成为实际应用和患者友好型诊断的理想选择。首先进行PCA提取特征,然后应用XGBoost集成学习分类器来有效识别收集到的指甲LIBS光谱之间的差异。所提出的框架通过使用支持向量机(SVM)模型进行交叉验证进行了系统性的基准测试,并通过独立的外部数据集进一步验证了其鲁棒性和泛化能力。指甲LIBS与集成算法的结合提供了一种新的无创CKD筛查方法。总体而言,本研究证明了将基于指甲的LIBS与集成学习结合的有效性,有助于开发无创、数据驱动的光谱诊断框架,符合对先进分析技术在生物医学和临床应用中日益增长的重视。

样本获取与准备

共有100名参与者参与了这项研究,其中包括55名(n=55)先前被诊断为慢性肾病(CKD)的个体和45名(n=45)健康对照组。所有CKD患者均在研究前由经过认证的医疗专业人员进行了诊断。健康对照组由没有任何CKD临床症状或家族史的人组成。指甲样本是在白沙瓦的一家医疗机构中从所有参与者那里收集的。

特征提取的PCA实现

通常,基于光谱数据区分感染和正常指甲样本具有挑战性,因为光谱变化很小。为了确保对LIBS光谱数据的准确解释,实施化学计量程序至关重要[17]。这些技术从复杂的数据集中提取相关信息,从而实现准确的样本分类。为此,采用了基于PCA的分类方法,并结合了XGBoost的集成能力。

指甲LIBS发射的光谱特征

来自指甲样本的等离子体发射线为光谱分析提供了基础。图4展示了一个典型的光谱,其中标出了明显的线条。
指甲样本的发射光谱主要显示在紫外线(UV)和可见光(VIS)波长范围内的光谱线。LIBS光谱表明存在钙(Ca)和镁(Mg)的中性和电离发射线。相比之下,钠(Na)、铁(Fe)等元素也有相应的光谱线。

通过外部数据评估

通过使用来自马尔丹一家医院的独立数据集进行外部验证,评估了模型的泛化能力,该数据集包括40名CKD患者和40名健康对照组。所有样本均按照相同的标准化协议获取。该数据集仅用于测试目的,无需重新训练模型。

与相关光谱诊断研究的比较

通过将激光诱导击穿光谱与机器学习模型结合用于诊断慢性肾病的效果,通过与先前实验技术和机器学习算法的比较分析进行了评估(表6)。这项分析将模型的性能置于更广泛的研究背景中,提供了对其相对优势和改进领域的关键见解。
如表6所示,我们的LIBS + XGBoost方法实现了更高的准确性

结论

当前的研究评估了基于LIBS的指甲样本元素分析在所研究队列中用于CKD分类的可行性。分析使用了包含100名个体的数据集。在分类之前进行了主成分分析以提取特征。为了评估模型的性能,评估了包括准确性、灵敏度、特异性和F1分数在内的指标。

参与同意声明

在收集指甲样本之前,向所有志愿者解释了研究的目的,并获得了每位参与者的知情同意。参与是自愿的,在整个研究过程中保持了保密性和匿名性。

伦理声明

本研究已获得巴基斯坦白沙瓦伊斯兰大学的伦理审查和批准。

资助

本工作得到了沙特阿拉伯国王费萨尔大学研究生研究和科学研究副校长办公室的科学研究系的支持[资助编号:KFU260393]

利益冲突声明

作者声明他们没有已知的财务利益或个人关系可能影响本文所述的工作。
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