通过高通量测序和贝叶斯全证据推断方法探索Leptanillinae亚科（膜翅目：蚁科）的系统发育关系，并考虑了系统偏差的影响

利用超保守元素（UCEs）结合贝叶斯和共时性框架分析，纠正了Leptanillinae亚科分类错误，证实Scyphodon与Leptanilla为同一物种，但部分形态学未分析的物种因数据不足无法确定系统发育位置。

　　

摘要

隶属于Leptanillinae亚科（膜翅目：蚁科）的蚂蚁体型微小且生活在地下环境中，由于雌雄个体分离，其分类学研究一直面临诸多困难。系统基因组学方法的出现解决了这一问题，为Leptanillinae亚科的系统发育关系提供了强有力的统计支持。然而，基因组规模的分子数据容易受到系统偏差的影响，这些偏差可能导致错误的结论。以往针对Leptanillinae亚科的系统基因组学研究并未解决这一问题，也未尝试确定那些基因信息无法获取的异常类群的系统发育位置。本研究利用超保守元件（UCEs）结合贝叶斯和频率主义方法以及基于共祖关系的分析框架，对Leptanillinae亚科的系统发育关系进行了研究，并通过多次使用经过整理的UCE比对结果来减轻系统偏差的影响。此外，还通过检查物种树中的某些节点是否位于基因树异常区域内来验证研究结果。尽管Leptanillinae亚科的系统位置尚未得到充分验证，但研究结果表明，将其归类为蚁科其他成员的姐妹群可能是因为在Leptanillinae亚科之外采样不足所致。为了确定单型属Scyphodon及其他三个缺乏分子数据的类群的系统发育位置，本研究还结合了贝叶斯全证据推断方法和雄性形态学数据。所推断的Leptanillinae亚科系统发育关系具有较强的稳定性，能够抵抗组成异质性和基因树不一致性的影响。先前将Scyphodon归为Leptanilla的同物异名的结论得到了高贝叶斯后验概率的支持；但由于系统发育信息不足或推断误差，其余仅基于形态学数据的类群的系统位置仍无法确定。

利益冲突声明

作者声明不存在任何利益冲突。

数据可用性声明

本研究中使用的所有非作者自行制作的图像均归AntWeb所有（https://www.antweb.org）。本研究使用的分子和形态学数据矩阵、分析输入文件及输出结果均可在Dryad平台上公开获取（https://doi.org/10.5061/dryad.b2rbnzst2）（Griebenow, 2026）。相关脚本也可在Zenodo平台上公开获取（https://doi.org/10.5281/zenodo.16781993）（Griebenow, 2025）。本研究新发布的序列原始数据（表S1）存储在NIH NCBI的Sequence Read Archive（SRA）中，项目编号为PRJNA629360，名为“基于系统基因组学推断的Leptanillinae亚科（膜翅目：蚁科）的系统修订”。