《Clinica Chimica Acta》：Targeted next-generation sequencing in diagnosing reproductive tract infections: a comparative study
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本研究评估了靶向下一代测序（tNGS）在疑似生殖道感染中的临床疗效，发现tNGS在HPV亚型检测和混合感染识别方面优于传统HPV检测方法，并补充了阴道微生态检测结果。
陈志阳|李子阳|谭莉|袁晓瑞|于艳|顾戈|张森淼|夏晓蒙|胡敏
中南大学第二湘雅医院临床实验室
摘要
目的
靶向下一代测序（tNGS）技术通过多重PCR扩增或探针捕获来富集病原体核酸，在传染性疾病的临床管理中逐渐受到关注。本研究旨在评估tNGS技术在疑似生殖道感染患者中的临床疗效。
方法
2024年6月至2024年8月期间，共有181名疑似生殖道感染的患者在中国长沙的第二湘雅医院接受了研究。所有参与者的阴道分泌物样本均接受了tNGS检测和人乳头瘤病毒（HPV）检测，其中一部分样本还进行了微生物生态学分析。研究对比了两种检测方法的诊断效能和一致性。
结果
在HPV检测方面，tNGS对HPV类型的覆盖范围更广，且对大多数亚型的检测灵敏度更高。tNGS与HPV检测结果完全一致的比例为71%，部分一致的比例为12%，不一致的比例为17%。在129例结果完全一致的患者中，tNGS额外检测出了12种病原体，主要为微小支原体（Ureaplasma parvum）、解脲支原体（Ureaplasma urealyticum）和巨细胞病毒（CMV）。此外，tNGS在检测混合感染方面具有显著优势。在比较阴道微生物生态学检测结果时，患有细菌性阴道病（BV）的患者中，HPV、CMV、白色念珠菌（Candida albicans）、人毛滴虫（M. hominis）、沙眼衣原体（Chlamydia trachomatis）、解脲支原体和微小支原体的检出率更高。
结论
tNGS能够检测更广泛的HPV亚型，具有更高的灵敏度，并能识别混合感染，使其成为传统HPV检测方法的有力替代方案。同时，tNGS也是阴道微生物生态学检测的理想补充。
研究背景
生殖道感染（RTIs）这一概念最早由国际妇女健康联盟于1987年提出，指的是由多种细菌、真菌、病毒和寄生虫引起的生殖道疾病。RTIs对患者造成严重影响，尤其是孕妇和计划怀孕的女性[1]。由于其高发且持续存在的社会经济影响，RTIs已成为全球范围内的重大公共卫生问题。
研究对象和研究设计
本研究共纳入了2024年6月至2024年8月期间在中国中南大学第二湘雅医院就诊的181名疑似生殖道感染患者。所有患者均签署了知情同意书，并接受了阴道分泌物采样以进行HPV检测和tNGS分析，其中部分患者还进行了阴道微生物生态学检测（n=164）。
纳入标准如下：(a) 具有相关临床症状的患者
临床特征
纳入患者的临床特征见表1。最常见的症状是术后宫颈上皮内瘤变（CIN）（n=23，12.7%），其次是外阴瘙痒（n=20，11.0%）、阴道出血（n=13，7.2%）、阴道分泌物增多（n=12，6.6%）和盆腔肿块（n=10，5.5%）等。
患者的阴道微生物生态状况显示，细菌密度以“+”（n=107，59.1%）和“++”（n=43，23.8%）为主。
讨论
本研究通过比较分析发现，tNGS的检测率和病原体覆盖范围均优于HPV27基因分型检测方法。此外，tNGS在识别混合感染方面具有显著优势，表明其可作为传统生殖道感染检测方法的竞争性替代方案。
HPV感染可能导致阴道菌群失衡和免疫功能下降
作者贡献声明
陈志阳：撰写初稿、资金筹集、数据管理。李子阳：资金筹集、数据管理。谭莉：数据管理。袁晓瑞：资金筹集、数据管理。于艳：方法学设计。顾戈：方法学设计。张森淼：方法学设计。夏晓蒙：撰写、审稿与编辑、概念构思。胡敏：撰写、审稿与编辑、资金筹集、概念构思。
资金支持
本研究得到了湖南省自然科学基金（编号：2023JJ40812；ZR）、国家自然科学基金（编号：82270658；MH；82102499；ZL）、湖南省重点研发计划（编号：2022SK2020；MH）以及中南大学研究生创新项目（编号：2024XQLH141；XY）的支持。
利益冲突声明
作者声明不存在可能影响本研究结果的已知财务利益或个人关系。
