LTER观测站HAUSGARTEN数据档案

《Deep Sea Research Part II: Topical Studies in Oceanography》:The LTER observatory HAUSGARTEN data archive

【字体: 时间:2026年03月15日 来源:Deep Sea Research Part II: Topical Studies in Oceanography 2.3

编辑推荐:

  北极 Fram Strait HAUSGARTEN 长期生态观测站25年累计生成200余项环境、生物及气候研究数据成果,为气候预测模型和深海生态研究提供关键数据支撑,并推动全球开放获取数据政策发展。

  
Autun Purser | Lilian Boehringer | Christopher Kr?mmer | Karsten Schimpf | Jennifer Dannheim
阿尔弗雷德·韦格纳研究所,亥姆霍兹极地与海洋研究中心,27570 不来梅港,德国

摘要

在运行的最初25年里,长期生态研究(LTER)观测站HAUSGARTEN收集了大量来自弗拉姆海峡(北极地区)的数据和数据类型。这些数据支持了200多篇主要涉及环境、生物和气候研究的出版物,并为气候预测模型以及其他大量数据分析提供了输入数据,研究范围从海面/海水气体交换到食物坠落区域附近的深海中型生物丰度。
这些数据对于未来跨学科研究生态系统功能及其对环境变化的响应具有巨大价值,同时也为其他研究提供了基础,例如时间序列上的动物群丰度或分布研究。为了更好地支持未来的研究工作,整个环境研究界一直在推动环境研究数据的永久存档,并使其免费向研究人员、公众和立法者开放。HAUSGARTEN观测站位于北极与大西洋的交汇处,在当前全球环境变化背景下显得尤为重要。
在本文中,我们介绍了开放获取的长期存储档案,这些档案保存了HAUSGARTEN观测站的许多监测和实验结果,并介绍了现在非直接参与数据收集的人员如何方便地访问这些档案的新方法。

引言

正如本特刊开篇所概述的,HAUSGARTEN观测站(Soltwedel等人,本期文章)自1999年以来从弗拉姆海峡(79°N)收集了大量多样化的数据,这些数据可能成为未来研究全球变暖对北极生态系统影响的关键资源。尽管已有200多篇论文利用了这些数据,但其主要优势在于其跨学科性质以及对未来研究人员的开放性,涵盖了从大气到莫洛伊深海区域在25年期间发生的众多物理和生物过程。
HAUSGARTEN观测站的建立正值关于人为气候变化现实性和严重性的重大社会和科学讨论之际,人们也在探讨这种变化可能如何影响自然环境以及我们对自然环境的利用(如渔业、娱乐、航运等)(Kessel, 2000; Sterman和Sweeney, 2002)。作为全球海洋环流的关键位置,该观测站覆盖了北极与大西洋盆地之间的水体交换(Karcher和Oberhuber, 2002),因此非常适合评估这些变化并预测未来的可能变化。
为了更好地支持未来的研究工作,必须适当地存档LTER项目收集的时间序列数据,并使其对研究人员、利益相关者和感兴趣的公众开放,理想情况下应遵循开放获取数据政策(Kratz等人,2003; Wilkinson等人,2016)。在HAUSGARTEN LTER运行的最初25年里,全球范围内越来越多人希望将这些数据集公开发布到国际可用的档案库中。作为HAUSGARTEN LTER工作的协调机构,阿尔弗雷德·韦格纳研究所(亥姆霍兹极地与海洋研究中心)完全支持这一趋势,遵循将所有空间环境数据存档到PANGAEA档案库中的机构方针(https://pangaea.de)(Felden等人,2023)。在过去十年中,已经建立了工作流程,能够将大部分HAUSGARTEN数据直接从研究船只自动导入PANGAEA,尽管某些数据类型(如动物群分析、基因样本、浮标传感器数据)需要在岸上进行进一步处理才能存档。
在本文发表时,一些HAUSGARTEN数据类型(如生物标本、基因序列、大型海洋中型生物图像集或大规模视频调查)还不能导入PANGAEA档案库;这些数据必须存储在机构服务器(可能非开放获取)或个别研究团队和科学家的手中。随着在线访问大型数据集的方法不断发展,以及存储成本的降低,存储在研究人员硬盘或研究所网络中的“难以访问”数据的比例逐年减少。
本文详细介绍了HAUSGARTEN在前25年期间收集的数据、数据的获取方式,以及未来25年数据收集的发展方向。

部分内容概述

LTER HAUSGARTEN最初25年的数据收集

HAUSGARTEN是一个特别多样化的观测网络,拥有21个关键站点,每年在这些站点测量多种参数(Soltwedel等人,本期文章;Soltwedel等人,2016)。这些测量既通过船只部署的传感器平台进行,也通过着陆器、海底浮标和冰浮标完成。此外,还从整个海域收集了eDNA样本、沉积物陷阱和泵取样本、细菌、中型生物、大型生物和巨型生物样本。

在线数据探索

在线可访问性的提高以及Web应用程序从远程档案中获取数据并直接在地图上显示数据的能力,使得可以开发出新的应用程序,使科学家能够快速结合不同数据集。这样的应用可以通过快速揭示潜在的协同效应来加速研究。综合性的研究方法可以大大帮助评估系统功能,例如von Appen等人的研究。

数据回顾与展望

截至2025年4月,HAUSGARTEN观测站最初25年期间收集的大部分数据已上传到在线存储库中(见第2节)。通过阅读项目启动以来发布的各种考察报告(https://www.awi.de/en/science/biosciences/deep-sea-ecology-and-technology/observatories/lter-observatory-hausgarten.html)和上述示例可以看出,并非所有数据都存储在易于访问的公共档案库中。

CRediT作者贡献声明

Lilian Boehringer: 数据可视化、调查、数据分析、数据管理。 Autun Purser: 写作——审稿与编辑、初稿撰写、数据可视化、方法论研究、数据分析、概念化。 Christopher Krammer: 写作——审稿与编辑、初稿撰写、方法论研究、数据分析。 Jennifer Dannheim: 写作——审稿与编辑、初稿撰写、数据管理。

利益冲突声明

作者声明他们没有已知的可能会影响本文所述工作的财务利益或个人关系。

数据可用性

本文中提到的所有数据均可通过相应子节中的链接从公共在线数据仓库或样本档案库获取。如果访问数据遇到困难,请联系AWI的Autun Purser或作者团队。

致谢

HAUSGARTEN观测站收集的数据主要由FRAM项目和在已发表论文中提到的各种AWI资助渠道提供支持。作者感谢许多致力于使HAUSGARTEN数据符合FAIR标准并可供未来几代研究人员、科学家和全球社区成员使用的科学家和数据管理者们的努力。
相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 搜索
  • 国际
  • 国内
  • 人物
  • 产业
  • 热点
  • 科普

知名企业招聘

热点排行

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号