编辑推荐:
AI辅助诊断技术在HSV Western blot检测中的应用研究。创新性提出两阶段AI工具BlotDx,通过实例分割识别条带再经分类模型判断HSV-1/HSV-2感染状态,在926例原始数据集和185例验证数据集上均达到超过97%的准确率,显著提升传统检测效率并减少人为误差。
卢卡斯·刘(Lucas Liu)| 萨拉斯瓦蒂·萨蒂斯(Saraswathi Sathees)| 阿妮埃拉·索贝尔(Aniela Sobel)| 格雷戈里·佩珀(Gregory Pepper)| 亚历山大·L·格林纳格(Alexander L. Greninger)| 基思·R·杰罗姆(Keith R. Jerome)| 方友义(Youyi Fong)| 帕维特拉·罗伊乔杜里(Pavitra Roychoudhury)
弗雷德·哈钦森癌症中心(Fred Hutchinson Cancer Center)公共卫生科学部门(Public Health Sciences Division)
摘要
背景
Western blot(WB)是检测单纯疱疹病毒(HSV-1/HSV-2)血清学的金标准,但需要经过培训的实验室人员进行手动解读,这一过程既耗时又存在一定的主观性。本研究介绍了BlotDx这一深度学习工具,旨在辅助HSV WB的解读,以提高效率和诊断的一致性。
方法
BlotDx采用两阶段方法:(1)通过实例分割或对象检测从输入图像中识别印迹(blots);(2)使用分类模型确定HSV-1和HSV-2的血清状态,排除不确定的结果。我们开发了三种不同的分类器,它们在信息处理流程上有所不同。主要数据集包含926对印迹,这些印迹来自2016-2017年间收集的样本,并于2018年拍摄;第二个机构验证数据集包含185对印迹,这些印迹来自2019-2024年间收集的样本,并于2025年在另一个实验室拍摄。
结果
通过与三位独立技术人员的专家评审结果进行5折交叉验证,BlotDx在主要数据集(HSV-1的准确率为98.8%,95%置信区间为97.9%-99.3%;HSV-2的准确率为98.9%,95%置信区间为98.0%-99.4%)以及机构验证数据集(HSV-1的准确率为97.3%,95%置信区间为93.8%-98.8%;HSV-2的准确率为96.2%,95%置信区间为92.4%-98.1%)中均表现出较高的诊断准确性。
结论
本研究展示了人工智能作为基于图像的检测方法(如HSV Western blot)的辅助工具的实用性,其应用潜力也扩展到其他疾病领域。所提出的两阶段方法结合现代深度学习技术,具有可扩展性,有助于通过降低成本和提高效率来变革传统的诊断工作流程。
章节摘录
引言
深度学习和人工智能(AI),尤其是卷积神经网络(CNN),彻底改变了图像分析领域,为自动化劳动密集型任务和标准化结果提供了解决方案,从而提高了准确性和效率(LeCun等人,2015年)。CNN目前广泛应用于放射学和病理学(Esteva等人,2021年),但在涉及图像解读的其他实验室诊断领域,深度学习的应用仍相对较少。Western blot(WB)
HSV WB图像和临床检测结果
本研究的数据是通过使用标准数码相机拍摄Western blot印迹获得的。这些印迹是根据补充方法中描述的临床验证方案制备的。每对印迹对应于一名患者血清样本的HSV-1和HSV-2血清学检测结果。印迹被粘贴在标有位置的白纸上,下方标注了每个患者样本的放置位置(每张纸最多可贴24对印迹),并在印迹下方添加了文本标签。
研究中使用的主要数据集和次要(机构验证)数据集
本研究的主要数据集包含926对印迹的图像(分为训练集、验证集和测试集,分别为315对、57对和554对),这些样本采集于2016年8月至2017年2月期间,并于2018年在华盛顿州西雅图的UW病毒学实验室拍摄。此外,为了训练实例分割模型,还包含了1至5张吸附实验的图像,这些图像上贴有6个印迹(见补充图S1)。在926对印迹中
讨论
本研究介绍了一种基于深度学习的计算机视觉AI工具(BlotDx),用于分析诊断性Western blot结果。虽然AI方法已应用于其他领域,如抄袭检测和乳腺癌检测(Gosselin,2025年;Llaguno-Roque等人,2023年),但据我们所知,BlotDx是首个将计算机视觉模型应用于临床实验室血清学诊断的工具。BlotDx能够从多例患者的图像中准确识别所有印迹,并在HSV-1的检测中实现了高准确率。
作者贡献声明
卢卡斯·刘(Lucas Liu):撰写内容、审稿与编辑、数据可视化、方法论设计、数据分析。阿妮埃拉·索贝尔(Aniela Sobel):撰写内容、审稿与编辑、数据管理。萨拉斯瓦蒂·萨蒂斯(Saraswathi Sathees):撰写内容、审稿与编辑、方法论设计、数据管理。亚历山大·L·格林纳格(Alexander L. Greninger):撰写内容、审稿与编辑、项目监督、资源协调、方法论设计、实验设计。格雷戈里·佩珀(Gregory Pepper):撰写内容、审稿与编辑、项目监督、方法论设计、数据管理。方友义(Youyi Fong):撰写内容、审稿与编辑、初稿撰写、数据可视化。
利益冲突声明
作者声明以下可能构成潜在利益冲突的财务利益和个人关系:帕维特拉·罗伊乔杜里(Pavitra Roychoudhury)在所描述的工作之外,与AiCuris Anti-Infective Cures GmbH签订了合同;亚历山大·格林纳格(Alexander Greninger)在所描述的工作之外,还接受了来自Abbott、Cepheid、Novavax、Pfizer、Janssen和Hologic公司的合同测试项目,并获得了Gilead的研究支持。其他作者均声明没有已知的利益冲突。