蔗茅EfBBX基因家族鉴定及冷胁迫下表达模式分析

　　

摘要：

目的 B-box型锌指蛋白（BBX蛋白）在抵御植物非生物胁迫中具有重要作用。蔗茅具有良好的耐冷性，可为甘蔗的耐冷遗传改良提供基因资源。对蔗茅EfBBX基因家族成员鉴定和特征分析，并探究其在冷胁迫中的生物学功能。 方法 从蔗茅全基因组中鉴定出EfBBX基因家族成员，通过生物信息学方法分析其理化性质、系统进化、染色体定位、共线性分析、基因结构、保守结构域和启动子顺式元件；RT-qPCR试验对EfBBX基因家族成员进行冷胁迫下的表达模式分析。以蔗茅无性系E2为材料，克隆EfBBX4、EfBBX10和EfBBX18基因CDS序列，并将EfBBX18基因在本氏烟草中进行瞬时表达。 结果 在蔗茅全基因组中鉴定出19个EfBBX基因家族成员，划分为5个亚家族，其不均匀分布于蔗茅10条染色体中的6条；亚细胞定位预测显示EfBBX蛋白主要位于细胞核和叶绿体中；EfBBX基因家族的启动子区域含有大量激素、非生物胁迫响应以及光响应相关元件；RT-qPCR实验证实，10个基因可以被冷胁迫诱导表达；成功克隆了EfBBX4、EfBBX10和EfBBX18基因，其中蔗茅EfBBX18在本氏烟草中的瞬时表达可增强烟草的耐冷性。 结论 从蔗茅基因组中鉴定出19个EfBBX基因，10个基因均可以被冷胁迫诱导表达，成功克隆3个基因，其中EfBBX18在本氏烟草中的瞬时表达可增强烟草的耐冷性。