衍生类器官-血管生成相关基因（DOARGs）在结直肠癌中的预后意义及分子机制

《Journal of Physiology and Biochemistry》：Prognostic implications and molecular mechanisms of derived organoid-angiogenesis-related genes (DOARGs) in colorectal cancer

结直肠癌预后研究基于衍生器官样-血管生成相关基因（DOARGs），通过TCGA/GEO数据库筛选并利用机器学习建立预后签名和Nomogram，验证显示该签名对CRC预后预测准确，不同风险组在TMB、免疫浸润、化疗及免疫治疗反应方面差异显著，qRT-PCR证实模型基因（TIMP1、MMP1、CCL24、MELTF、LEF1）在CRC细胞中高表达且CCL24低表达抑制细胞功能。

　　

摘要

本研究旨在探讨衍生类器官-血管生成相关基因（DOARGs）在结直肠癌（CRC）中的预后意义及其分子机制。基于癌症基因组图谱（TCGA）和基因表达组学数据库（GEO），筛选出与CRC预后相关的DOARGs。利用机器学习技术构建并评估了基于DOARGs的预测标志物，并绘制了相应的诺模图（nomogram）。此外，还分析了肿瘤突变负担（TMB）水平、免疫浸润情况、潜在的化疗药物以及免疫治疗反应，以评估不同风险组之间的差异。通过体外实验（包括定量逆转录聚合酶链反应（qRT-PCR）、Western blot、CCK-8和Transwell检测）验证了这些模型基因的表达和分子机制。最终确定了13个与预后显著相关的DOARGs。其中5个基因（组织金属蛋白酶抑制剂1（TIMP1）、基质金属蛋白酶1（MMP1）、C-C基序趋化因子配体24（CCL24）、黑色素转移蛋白（MELTF）和淋巴细胞增强因子1（LEF1）被选为用于建立预后预测标志物的候选基因。经验证，该预测标志物对CRC预后的预测能力表现出较强的可靠性。不同风险组在TMB、免疫浸润、潜在化疗反应和免疫治疗反应方面存在显著差异。将肿瘤样本分为C1组和C2组，结果显示C1组的生存率明显低于C2组。qRT-PCR分析显示，这5个模型基因在CRC细胞中的表达显著上调，而CCL24的低表达会抑制CRC细胞的生物学功能。本研究利用DOARGs开发了一种CRC预后预测标志物，为CRC的预后评估和个性化治疗提供了新的靶点。