对多组学数据的计算分析表明，CXCL10+树突状细胞（DC）与调节性T细胞（Treg）之间的相互作用促进了AFP阳性肝细胞癌（hepatocellular carcinoma）中的免疫抑制微环境

《Cellular and Molecular Life Sciences》：Computational analysis of multi-omics data reveals CXCL10+ DC-Treg interaction drives immunosuppressive microenvironment in AFP-positive hepatocellular carcinoma

血清α-胎蛋白（AFP）阳性肝癌的免疫微环境特征及其与免疫治疗抵抗的关系。通过整合单细胞、 bulk和空间转录组数据，发现AFP阳性肝癌中STMN1+和AFP+肿瘤细胞富集，而CYP3A4+细胞在阴性组中富集。免疫分析显示Tregs和CXCL10+ DCs在阳性组中显著增加且空间邻近，二者正相关，其相互作用形成免疫抑制微环境，与免疫治疗无响应相关。本研究为AFP阳性肝癌的免疫治疗靶点提供新见解。

　　

摘要

血清甲胎蛋白（AFP）是用于肝细胞癌（HCC）临床诊断和预后评估的最常用生物标志物之一。然而，其在指导治疗策略方面的潜在作用仍有限，主要是因为AFP阳性HCC的肿瘤微环境尚未得到充分研究。我们整合了多种类型的公共转录组数据，系统地分析了AFP阳性HCC的特征及其与免疫治疗的相关性。具体而言，我们使用了来自多个独立公共队列的单细胞RNA-seq数据、批量RNA-seq数据以及空间转录组数据。研究发现，在AFP阳性肿瘤组织中，STMN1⁺和AFP⁺恶性细胞亚群较为丰富，而在AFP阴性HCC中则CYP3A4⁺恶性细胞较为丰富。在免疫微环境方面，我们重点关注了两种关键免疫细胞类型：调节性CD4⁺ T细胞（Tregs）和树突状细胞（DCs）。我们发现，在AFP阳性HCC中，Tregs和CXCL10⁺ DCs（高表达CXCL10的DCs）的数量均有所增加，并且这两种细胞类型在多个数据集中表现出高度显著的正相关关系。空间转录组分析显示了它们之间的空间邻近性，表明CXCL10⁺ DCs与Tregs之间的相互作用塑造了AFP阳性HCC的免疫抑制环境。对接受免疫治疗患者的单细胞和空间转录组数据的分析表明，这两种细胞类型的数量增加及其空间邻近性与免疫治疗的无反应性有关。我们的研究基于公共数据的计算和分析，揭示了CXCL10⁺ DCs与Tregs之间的相互作用可能是形成AFP阳性HCC免疫抑制微环境的关键因素。这不仅增强了研究人员对AFP阳性HCC微环境的理解，还为AFP阳性HCC的治疗提供了潜在的靶点。