《European Journal of Cancer》：GENEO STUDY: COMPREHENSIVE GENOMIC PROFILING VERSUS LIMITED LOCAL REIMBURSED NGS PANELS WITHIN THE BELGIAN PRECISION INITIATIVE
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本研究比较了全面基因组检测（CGP）与现有本地NGS面板在1000名晚期癌症患者中的临床价值，发现CGP显著提升靶向治疗建议，使61%患者获得新疗法，但治疗可及性仍是主要挑战。
Gordana Raiceivc Toungouz|Aline Hebrant|Simon Nannini|Cédric Van Marcke|Julie Maetens|Lore Decoster|Sylvie Rottey|Wim Demey|Jo?lle Collignon|Annemie Rutten|Isabelle Vanden Bempt|Joanna Vermeij|Sabine Tejpar|Jean-Luc. Canon|Tom Van den Mooter|Willem Lybaert|Joni Van der Meulen|Nicky D’Haene|Jeroen Mebis|Hans Prenen|Philippe Aftimos
Sciensano - 癌症中心，布鲁塞尔，比利时
摘要
背景
肿瘤学中的分子诊断正从靶向下一代测序（NGS）面板转向全面的基因组分析（CGP），后者能够检测更广泛的基因改变，并增加患者参与临床试验和接受治疗的机会。
方法
本研究评估了CGP相较于当前比利时实践的附加价值，后者使用基于癌症类型设定的最低限度基因集的本地NGS面板。我们在13家比利时医院前瞻性地招募了1000名患有转移性或局部晚期癌症的患者。肿瘤组织或液体活检样本使用FoundationOne CDx检测方法进行分析。CGP的附加价值通过国家分子肿瘤委员会（nMTB）提出的额外治疗建议来衡量。
结果
93%的患者从CGP中受益。在同时接受了本地NGS和CGP检测的患者中，48%的患者至少收到了一项基于CGP的nMTB建议。总体而言，CGP提供的靶向治疗建议是本地NGS面板的两倍多，nMTB为61%的患者提供了治疗建议。在可评估的患者（n=586）中，23%接受了nMTB推荐的治疗。不遵从建议的原因包括治疗不可用（25%）、病情迅速恶化（24%）、患者选择（17%）或医生决定（15%）。在接受nMTB建议治疗的患者中，大多数参与了临床试验（48%），其次是标准治疗（35%）和超适应症治疗（16%）。
结论
GeNeo研究表明，与小型且报销有限的本地NGS面板相比，CGP通过显著提高可操作基因改变的检测率和靶向治疗建议的数量，提供了更大的临床价值。
部分内容摘录
引言
精准医学是当代肿瘤学的重要支柱。下一代测序（NGS）应用于组织或液体活检，可以通过识别可靶向的突变和药物耐药机制来指导治疗，从而提高癌症患者的生存率和生活质量[1]、[2]、[3]、[4]。尽管在肿瘤特异性和组织非特异性的环境中已经批准了基于生物标志物的治疗方法[5]，但全面基因组分析（CGP）的获取仍然有限。
研究设计和伦理批准
该临床研究方案由BSMO的PRECISION工作组设计（NCT04641676，注册日期为2020年11月24日）。研究遵循《赫尔辛基宣言》的原则、良好临床实践指南以及所有适用的监管要求进行。所有患者均签署了书面知情同意书，包括同意对其基因组数据进行分析并记录在centralized PRECISION.be数据库中。该研究获得了
患者特征
2020年10月至2022年4月期间，共有1000名患者入组。900名患者中有843名的组织活检样本成功进行了CGP检测，剩余100名患者中有94名的液体活检样本成功进行了CGP检测（表1a）。中位年龄为64岁（28–80岁），其中54%为女性，46%为男性。研究涵盖了25种不同的肿瘤类型，最常见的包括乳腺癌（n=137，14.6%）、结直肠癌（n=128，13.6%）、罕见肿瘤（n=100，10.7%）和胰腺癌（n=？）。
讨论
本地报销的NGS面板针对的是一组有限但具有临床重要性的基因区域，能够为许多癌症患者确定适当的治疗方案、确认诊断并进行预后评估，同时在成本效益和临床实用性之间取得了平衡。然而，这些面板大多忽略了较少见的肿瘤-基因型关联，而这些关联实际上占癌症患者的20-40%[4]。多项研究已经记录了这一点。
伦理批准和参与同意
所有参与机构的伦理委员会均根据伦理指南批准了这项研究。所有患者在入组前均签署了书面知情同意书。
资金支持
本研究得到了罗氏公司的支持，该公司提供了研究所需的资金和Foundation Medicine试剂盒。患者随访期间的数据收集得到了比利时抗癌基金会的PRECISION项目的资助。
利益冲突声明
作者声明以下可能被视为潜在利益冲突的财务利益和个人关系：PA：Boehringer Ingelheim、Macrogenics、Roche、Novartis、Amcure、Servier、G1 Therapeutics、Radius、Deloitte、Daiichi Sankyo、Olema；酬金：Synthon、Amgen、Novartis、Gilead、Lilly、Menarini；差旅费用：Amgen、MSD、Pfizer、Roche、Daiichi Sankyo；对我所在机构的研究资助：Roche；NDH：顾问委员会成员、咨询工作、演讲活动
致谢
我们感谢所有患者的参与，感谢罗氏比利时团队的支持，以及MTB成员为此项目付出的时间和努力。同时感谢Nicolas Loucheu提供的技术支持。
数据共享
本研究生成和/或分析的数据集可应合理要求提供。出版同意
作者已同意发表本文。
