头足类动物主要包括鱿鱼、墨鱼和章鱼，占全球海产品总量的约2.5%，2024年的产量记录为350万吨（FAO, 2024, Stiepani et al., 2025）。其中大部分产量来自亚洲国家，特别是中国、日本、泰国、韩国和越南（Ospina-Alvarez et al., 2022），台湾也做出了重要贡献（Lu, 2002）。台湾国内头足类动物的主要捕捞方式是使用火把网和拖网捕捞墨鱼和近岸鱿鱼，如loliginids（Wang et al., 2008）。2015年至2019年间，头足类动物占火把网渔业总捕捞量的约62%，产量接近17万吨（Nguyen et al., 2021）。这些种群主要来自台湾海峡、东海和黄海渔场（Lu, 2002）。据预测，2023年台湾的鱿鱼捕捞量将达到7157吨，估计价值为14亿新台币（渔业局，2022）。值得注意的是，台湾的北部渔业社区对鱿鱼产业及其衍生产品贡献巨大（Haghi Vayghan et al., 2024）。Lu和Chung（2017）列出了在台湾周边水域常见的8种Loliginidae物种。其中，Uroteuthis edulis、U. chinensis、U. duvaucelii和Sepioteuthis lessoniana是最主要且市场销量最大的种类（Chang et al., 2014, Chen et al., 2016）。它们的繁殖高峰期每年从4月持续到10月（Lian, 2013, Qiu, 2015）。
Uroteuthis edulis，俗称“剑尖鱿鱼”，是一种分布于印度-太平洋地区的近岸物种（Pang et al., 2024）。其最密集的栖息地分布在西太平洋——从日本海北部延伸到东南亚的热带水域，以及澳大利亚北部海域（Jereb and Roper, 2010, Yamaguchi et al., 2020）。在印度洋，其分布范围向西延伸至波斯湾和红海，向南至莫桑比克海岸（Jereb and Roper, 2010）。该物种根据繁殖季节性表现出不同的生活史策略。在东海，至少存在三个繁殖群体：一个是冬季-春季群体，生长迅速且体型较大；第二个是夏季群体，生长缓慢，体型较小，主要分布在温暖水域；第三个是秋季群体，体型粗壮，触手较长，吸盘较大（Chang et al., 2022, Yamaguchi et al., 2017）。Takemoto和Yamashita（2012）的线粒体基因组比较研究表明，这些季节性群体确实是同一物种，相似度超过99%。尽管最近的一项研究基于线粒体细胞色素氧化酶I（COI）序列提出了东海北部存在三个不同的U. edulis支系，但序列对之间的核苷酸差异非常大（平均190个碱基对中有190个不同），这表明物种鉴定的准确性存在不确定性（Yang et al., 2025）。从更广泛的地理角度来看，Morgan等人（2024）将U. edulis描述为一个由至少四个支系组成的复合物种，其中三个支系分布在西太平洋，另一个支系分布在印度洋地区。在中国沿海，已经识别出两个不同的支系——一个位于东海，另一个位于南海（Jin et al., 2022）。然而，在台湾水域中，主要研究的是与东海相关的支系，这主要是由于它对当地渔业的巨大贡献。关于这一支系的研究涵盖了多个生物学和生态学方面，包括迁徙（Pang et al., 2024, Yamaguchi et al., 2015, Yamaguchi et al., 2022, Yamaguchi et al., 2017）、生活史（Jin et al., 2019, Pang et al., 2020）、比较分类学（Jin et al., 2022）、高级系统发育（Jiang et al., 2018）、生殖生物学（Guo et al., 2023）、种群动态（Ching and Chen, 2025）和渔业评估（Chang et al., 2022）。相比之下，靠近南海的支系受到的科学关注较少，尽管在该地区较为常见（Jin et al., 2022）。此外，U. edulis的成年个体与其近亲U. chinensis在形态上有相似之处。这两种物种在体型（最大400毫米，通常市场销售时为200毫米）、颜色（无色透明、鲜红色或任何中间色调）、预期寿命（<200天）和分布范围（Jin et al., 2022, Sin et al., 2009）上有所重叠。区分这两种物种最直接的形态学特征是第三腕和触手环的特征，但在现场即时鉴定中仍可能存在挑战（补充表1）。
生物信息，如从鱿鱼耳石中获得的生长环增量，反映了其生活史的特点（Rodhouse and Hatfield, 1990）。Jin等人（2019）报告称，在中国海域，雄性和雌性U. edulis种群之间存在不同的生长模式，这与它们的年龄有关。大约在140天时，雄性的生长速度相对较慢；而在175天左右，雄性的体型稳定在200毫米，而雌性的生长则持续到200天后（Jin et al., 2019）。在台湾东北部海岸，Ching和Chen（2025）也报告了两个U. edulis群体的存在及其体型结构上的差异。根据Yamaguchi等人（2015）的研究，冬季-春季和夏季群体在幼年阶段共同栖息在东海，然后逐渐向东北方向迁移。然而，冬季-春季群体必须忍受寒冷的水域，而夏季群体则在水域逐渐变暖时同步迁移（Yamaguchi et al., 2022）。Li等人（2021）指出，耳石中沉积的微量元素水平在两个群体中有所不同。秋季群体也观察到了类似的向东北方向迁移现象，这可能是为了利用温跃层帮助它们迁移（Yamaguchi et al., 2017）。Pang等人（2024）的耳石分析还表明，日本南部和台湾北部共享同一个U. edulis种群。这进一步强调了成年觅食地可能因地区而异，但孵化地点可能相似。根据历史记录，1995年至2015年间台湾每年的U. edulis捕捞量约为1万吨，2001年后日本的捕捞量也相当（Pang et al., 2020, Wang et al., 2008）。
台湾在之前关于西北太平洋U. edulis的遗传研究中是一个缺失的环节，这些研究主要集中在东海和南海的中国海岸。台湾海峡是连接这两个海域的通道，其区域海洋学也受到季节性影响（Jan et al., 2002）。其季节性变化的海洋环流模式调节了各种北部冷水物种与南部温水物种的分布动态，涉及多种鱼类和无脊椎动物（Chen et al., 2021, Cheng et al., 2022, Lin et al., 2021, Lin et al., 2025, Mondal et al., 2024）。此外，将分子生物学方法与耳石微结构分析相结合，可以为谱系分化、生长模式和生活史差异提供互补见解，有助于解决鱿鱼中的隐秘群体问题；然而，这种综合研究在该地区仍大多未被探索。因此，本研究旨在利用分子工具确定台湾海峡南部U. edulis的遗传群体及其相应的分布范围，同时描述研究较少的南部种群的生物学特征。通过将群体遗传学与基于耳石的生活史分析相结合，本研究填补了上述知识空白，并对该地区的这一种群提供了基本的生物学和进化评估。
