靶向下一代测序技术在社区获得性肺炎儿童中的应用

《European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases》：Application of targeted next-generation sequencing in children with community-acquired pneumonia

儿童社区获得性肺炎（CAP）病原诊断研究显示，靶向测序（tNGS）联合传统方法（CTs）对1245例患儿感染诊断率达89%，显著高于CTs单独使用。tNGS在细菌、病毒及混合感染诊断中准确率均超90%，与细菌培养符合率70%、抗原检测符合率90%。主要病原为肺炎支原体（45%）、鼻病毒（17.4%）、流感嗜血杆菌（15.9%），其中34.6%支原体携带A2063G突变。研究证实tNGS在儿科CAP病原诊断中具有更高准确率和更广检测范围。

　　

摘要

背景

儿童社区获得性肺炎（CAP）是全球儿童发病率和死亡率的主要原因之一，因此准确鉴定病原体对临床管理至关重要。靶向下一代测序（tNGS）在传染病诊断中起着关键作用，但目前仍缺乏关于其在儿童CAP中应用效果的系统性研究。

方法

本研究回顾性分析了2024年1月至2024年12月期间在温州市人民医院儿科病房治疗的1,245例儿童CAP病例。评估了tNGS结果与传统临床方法（CT）与临床诊断的一致性。此外，还将tNGS检测到的病原体结果与细菌培养和病毒抗原检测结果进行了比较。

结果

通过结合CT和tNGS技术，89%的儿童CAP感染得到了明确诊断，仅有11%的感染原因不明。在所有病原体感染中，肺炎支原体的比例最高（44.98%），其次是鼻病毒（17.35%）和流感嗜血杆菌（15.90%）。在肺炎支原体中，A2063G突变株占34.64%。tNGS在儿童CAP患者中对于细菌、病毒及混合感染的临床诊断符合率超过90%，显著高于CT的结果。同时，tNGS与抗原检测的符合率超过90%，与细菌培养结果的符合率超过70%。

结论

与CT相比，tNGS具有更高的临床符合率和更广泛的病原体检测范围。因此，它在病原体诊断方面具有巨大潜力，并为儿童CAP的临床治疗提供了宝贵的指导。