使用全面的下一代测序（NGS）技术对穆尔西亚地区的居民进行遗传性乳腺癌和卵巢癌的基因检测

《Familial Cancer》：Genetic testing for hereditary breast and ovarian cancer in the Murcian population using a comprehensive NGS panel

研究对414名符合SEOM标准的HBOC家系中 proband（IC）进行50基因面板NGS检测，其中20个为NCCN推荐的actionable基因，诊断率15%。结果显示BRCA基因贡献度（60%）显著高于非BRCA基因（40%），且通过重新评估和算法优先级处理，将25.38%的VUS归为良性，6.2%重新评级。证实HBOC检测应限定于actionable基因，VUS重新评估和优先级算法可优化实验室资源。

　　

摘要

传统上，遗传性乳腺癌和卵巢癌综合征（HBOC）与BRCA1和BRCA2基因中的致病性或可能致病的变异（PV/LPV）相关。然而，越来越多的证据表明，这种疾病的遗传背景具有异质性，其他癌症易感基因中的PV/LPV也会显著增加患病风险。本研究分析了来自穆尔西亚地区的414例符合2019年西班牙医学肿瘤学会（SEOM）诊断标准的HBOC患者，使用下一代测序（NGS）技术进行了检测。研究采用了包含20个临床可操作基因的50基因检测面板，这些基因由美国国家综合癌症网络（NCCN）推荐用于HBOC的检测。仅基于该检测面板中的20个临床可操作基因，诊断灵敏度达到了15%，其中同时患有乳腺癌和高级别浆液性上皮卵巢癌的患者的检出率最高。值得注意的是，仅依据2019年SEOM指南中的乳腺癌个人病史标准进行检测时，携带PV/LPV的HBOC患者识别率较低。研究还发现，BRCA基因对HBOC的贡献大于非BRCA基因（分别为60%和40%）。最后，对意义不明确的变异（VUS）进行重新评估后，其数量大幅减少：最初被识别的VUS中有25.38%被重新分类为良性或可能良性；在应用优先级排序算法后，剩余97个变异中有6个（6.2%）被列为高优先级。本研究证实了在常规临床实践中将HBOC基因检测限制在临床可操作基因范围内的重要性。对VUS的重新评估和优先级排序也非常关键，因为这有助于临床实验室更高效地管理资源。