《Leukemia》：KMT2A-rearranged B-lymphoblastic lymphomas are skewed towards a more mature developmental stage
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本研究旨在探索儿童KMT2A重排B淋巴母细胞淋巴瘤（B-LBL）与骨髓浸润性急性淋巴细胞白血病（B-ALL）之间的分子表型差异及其临床意义。研究人员通过转录组、免疫组化与免疫球蛋白重组分析，揭示KMT2A重排B-LBL/EM B-ALL倾向于起源于更成熟的B细胞阶段，且以MLLT1/3/10为融合伴侣，无KMT2A::AFF1融合。这提示组织源性KMT2A重排病例可能代表一种生物学上更成熟、侵袭性较低的亚型，为风险分层与治疗监测提供新见解。
在血液肿瘤领域，KMT2A基因重排是一种令人揪心的改变，因为它通常与急性淋巴细胞白血病（B-ALL）和急性髓系白血病（AML）患者的不良预后紧密相关。然而，一个有趣的现象引起了研究人员的注意：在B淋巴母细胞淋巴瘤（B-LBL）——B-ALL的非白血病“兄弟”中，KMT2A重排似乎并未显著影响患者的无进展生存和总生存期。尽管临床上两者在诱导、巩固和维持阶段的治疗方案近乎相同，但这种生存结局的差异却十分显著。B-LBL的特点是存在组织肿块，而骨髓（BM）浸润很低甚至没有。这种独特的临床表现与结局差异，不禁让人猜想：KMT2A重排的B-LBL是否在分子层面拥有其独特的“身份标识”？它与KMT2A重排B-ALL的髓外（EM）表现又有何异同？为解开这些谜团，研究者对一组儿童患者的组织样本展开了深入的分子“探案”，试图揭示其背后的生物学特征，这或许能解释为何“同病”却“不同命”。相关研究成果已发表于《Leukemia》期刊。
为了探究KMT2A重排B-LBL的分子特征，研究人员利用了来自基尔大学血液病理学系的石蜡包埋活检组织样本，构建了包含KMT2A重排B-LBL (n=14)、KMT2A重排EM B-ALL (n=6) 及非KMT2A重排对照 (n=32) 的队列。研究综合运用了高通量RNA测序（RNA-seq）进行差异表达与富集分析，免疫组织化学（IHC）结合QuPath数字病理图像分析定量蛋白质表达，以及Euroclonality捕获测序技术分析免疫球蛋白基因（IGH/IGL）的重排状态，并利用ALLCatchR基因表达分类器预测细胞的发育轨迹起源。
KMT2A重排在B-LBL中表现出低TdT表达及更成熟的细胞分化阶段
通过比较KMT2A重排与非重排样本的转录组，研究人员发现KMT2A重排样本中，与早期B细胞发育相关的基因，如DNTT（编码TdT蛋白）、RAG1和MME（编码CD10）显著下调。免疫组化分析（）及其量化结果（图1B, C）证实，KMT2A重排组的TdT阳性细胞比例显著更低。为区分这种低表达是源于极原始的干细胞样细胞还是已更成熟的B细胞，研究使用ALLCatchR分类器分析，结果显示KMT2A重排样本的Pre BI（前B细胞I期）评分显著降低，而Pre BII Large和Immature（不成熟B细胞）评分升高（图1D），这支持了其细胞起源处于相对更成熟的B细胞分化阶段。此外，对IGH和IGL基因重排的分析（图1E）显示，KMT2A重排样本中存在显著更多的、呈胚系序列的生产性（productive）克隆性重排，但无体细胞超突变迹象。这表明KMT2A重排B-LBL/EM B-ALL具有成熟的转录谱和免疫球蛋白重排模式，其起源细胞处于一个更成熟但仍属于前体细胞的阶段。
基于DNTT表达的B-ALL亚组分型
在B-ALL和AML中，KMT2A重排存在两个转录亚组：一类类似早期/多能细胞，另一类具有定向/成熟细胞特征。本研究在儿童B-LBL/EM B-ALL队列中发现KMT2A的融合伴侣分布与典型B-ALL不同：未检出KMT2A::AFF1融合，而均为MLLT1 (38%)、MLLT3 (31%) 和MLLT10 (31%)（图2A）。对公共B-ALL队列数据的分析进一步揭示，几乎所有KMT2A::AFF1融合样本的DNTT表达都高，而KMT2A与MLLT1/3/10的融合样本则表现出DNTT表达的异质性，部分高表达，部分低表达（图2B）。重要的是，在公共队列中，一组DNTT低表达的KMT2A重排B-ALL同样表现出更成熟的转录表型和更高的生产性IG重排数量（图2C, D），这与本研究的B-LBL发现一致。
结论与意义
本研究通过对一个独特的儿童患者队列的分析，揭示了KMT2A重排B-LBL及组织来源B-ALL样本具有区别于经典骨髓/血液来源KMT2A重排B-ALL的鲜明特征。尽管通常伴有较少的伴随驱动突变，但这类组织性病例展现出更成熟的表型，且不携带KMT2A::AFF1融合。相比之下，骨髓来源的KMT2A重排儿童B-ALL中约70%为不成熟表型，约50%为KMT2A::AFF1融合。这些数据表明，KMT2A重排发生于更定向/成熟的细胞，可能是导致高组织播散伴随低骨髓浸润的先决条件。这一假说得到了基因集富集分析（GSEA）的支持，该分析显示KMT2A重排活检组织中与侵袭性和运动性相关的基因富集。鉴于高度不成熟/多能细胞表型与不良预后和治疗期间微小残留病（MRD）下降缓慢相关，本研究发现的成熟表型特征或许解释了为何KMT2A重排在B-LBL中不与不良预后相关。此外，在DNTT低表达的B-ALL样本中，与侵袭性相关的MYC信号显著降低。综上，本研究表明组织性KMT2A重排病例可能代表一种生物学上独特、潜在侵袭性较低的亚型。这一发现对理解疾病生物学、优化风险分层以及制定更精准的治疗监测策略具有重要意义。
