Actinotalea endophytica sp. nov.，一种从Sonnneratia apetala中分离出的新型内生放线菌

《Current Microbiology》：Actinotalea endophytica sp. nov., a Novel Endophytic Actinobacterium Isolated from Sonneratia apetala

从 Sonneratia apetala 树皮分离的放线菌 strain M2MS4P-6T 经多相分类学分析确认为新种 Actinotalea endophytica sp. nov., 其 16S rRNA 与属内种属差异显著，并具有适应红树林环境的渗透调节系统。

　　

摘要

从经过表面消毒的树皮中分离出一种革兰氏染色阳性、杆状、需氧的放线菌，命名为M2MS4P-6^T菌株。该菌株能够在15–40°C（最适温度为30–37°C）的温度范围内生长，在pH 6–8（最适pH值为7）的条件下存活，并且能在0–11%（w/v）的NaCl溶液中生长（最适浓度为2%）。M2MS4P-6^T菌株的16S rRNA基因序列与Actinotalea属的成员具有高度相似性（相似度为95.5–98.9%）。基于16S rRNA基因序列及最新细菌核心基因的系统发育树分析表明，M2MS4P-6^T菌株与Actinotalea lenta GDMCC 1.3827^T菌株紧密聚类，并形成了一个独立的进化分支。数字DNA-DNA杂交实验（相似度为19.5–21.6%）、平均核苷酸同一性（72.5–78.7%）和平均氨基酸同一性（55.3–75.9%）的结果均低于物种划分的阈值，这表明M2MS4P-6^T菌株属于Actinotalea属的新物种。M2MS4P-6^T菌株的基因组G+C含量为72.9%。其主要极性脂质包括二磷脂酰甘油、磷脂酰甘油、磷脂酰肌醇甘露糖苷、一种未鉴定的磷脂以及两种未鉴定的脂质。其主要呼吸醌类化合物为MK-8(H₄），主要脂肪酸为C_16:0、anteiso-C_15:0和C_14:0。基因功能分析显示，M2MS4P-6^T菌株具有有效的渗透调节系统，以适应红树林环境。根据多相分类学数据，M2MS4P-6^T菌株被认定为一个新的Actinotalea物种，建议将其命名为Actinotalea endophytica新种。模式菌株为M2MS4P-6^T（= CGMCC 4.7527^T = KCTC 49194^T）。

从经过表面消毒的树皮中分离出一种革兰氏染色阳性、杆状、需氧的放线菌，命名为M2MS4P-6^T菌株。该菌株能够在15–40°C（最适温度为30–37°C）的温度范围内生长，在pH 6–8（最适pH值为7）的条件下存活，并且能在0–11%（w/v）的NaCl溶液中生长（最适浓度为2%）。M2MS4P-6^T菌株的16S rRNA基因序列与Actinotalea属的成员具有高度相似性（相似度为95.5–98.9%）。基于16S rRNA基因序列及最新细菌核心基因的系统发育树分析表明，M2MS4P-6^T菌株与Actinotalea lenta GDMCC 1.3827^T菌株紧密聚类，并形成了一个独立的进化分支。数字DNA-DNA杂交实验（相似度为19.5–21.6%）、平均核苷酸同一性（72.5–78.7%）和平均氨基酸同一性（55.3–75.9%）的结果均低于物种划分的阈值，这表明M2MS4P-6^T菌株属于Actinotalea属的新物种。M2MS4P-6^T菌株的基因组G+C含量为72.9%。其主要极性脂质包括二磷脂酰甘油、磷脂酰甘油、磷脂酰肌醇甘露糖苷、一种未鉴定的磷脂以及两种未鉴定的脂质。其主要呼吸醌类化合物为MK-8(H₄），主要脂肪酸为C_16:0、anteiso-C_15:0和C_14:0。基因功能分析显示，M2MS4P-6^T菌株具有有效的渗透调节系统，以适应红树林环境。根据多相分类学数据，M2MS4P-6^T菌株被认定为一个新的Actinotalea物种，建议将其命名为Actinotalea endophytica新种。模式菌株为M2MS4P-6^T（= CGMCC 4.7527^T = KCTC 49194^T）。