《Nature Communications》:A high-throughput conditioned-media-based screening system identifies inhibitors of aggregation induced by iPSC-secreted amyloid β
编辑推荐:
在常规体外筛选中,候选药物常因模型生理相关性不足而在后续研究中失败。为解决此问题,研究人员开发了名为HaiDap的高通量条件培养基筛选系统,利用阿尔茨海默病患者iPSC分化的细胞条件培养基,对22种可食用植物提取物进行筛选,成功鉴定出3种能显著延缓淀粉样蛋白Aβ在神经元表面聚集的抑制剂。该系统为高效、精准、低成本地发现淀粉样蛋白聚集抑制剂提供了新策略。
在探索对抗阿尔茨海默病等神经退行性疾病的漫长征途中,新药研发始终面临着一个严峻的“瓶颈”:许多在实验室简单体外模型中表现出潜力的候选化合物,一旦进入更复杂的体内环境或临床研究阶段,效果便大打折扣甚至完全失效。这背后的一个核心问题在于,传统的体外筛选模型常常过于简化,无法充分模拟人体内复杂的生理环境和疾病过程。与此同时,利用患者来源的诱导多能干细胞(Induced Pluripotent Stem Cell, iPSC)构建的疾病模型,虽然能提供更高的生理相关性,重现疾病的关键特征,但其高昂的培养和分化成本,又极大地限制了它们被用于大规模、高通量的药物筛选。如何兼顾模型的“生理相关性”与筛选的“高通量、低成本”,成为横亘在研究者面前的一道难题。
为了解决这一矛盾,一项发表于《Nature Communications》的研究带来了一项创新技术。研究团队开发了一套名为“HaiDap”(High-throughput screening technology for Aggregation Inhibitors of Diseased cell-derived Aggregative Proteins)的高通量筛选系统。该系统巧妙地绕过了直接使用iPSC分化细胞进行筛选的高成本障碍,而是利用了这些“患病”细胞释放到培养环境中的关键致病因子。研究者们设想,如果能用这种富含疾病特异性生物活性分子的“条件培养基”来进行大规模筛选,或许就能在保留iPSC模型生理相关性的同时,实现高效、低成本的药物发现。
为了验证这一设想,研究人员将目光聚焦于阿尔茨海默病的经典病理蛋白——淀粉样蛋白β(Amyloid-β, Aβ)。Aβ的异常聚集和沉积,是阿尔茨海默病大脑中标志性老年斑的主要成分,也被认为是驱动神经毒性、引发神经元损伤和死亡的核心环节之一。因此,找到能够有效抑制Aβ聚集的分子,是药物研发的重要方向。研究团队从一名男性阿尔茨海默病患者的细胞出发,制备了诱导多能干细胞,并将其定向分化为能够分泌Aβ的细胞类型。随后,他们收集这些细胞的条件培养基,其中包含了由患病细胞自然产生和分泌的Aβ以及其他相关分子。以此作为筛选的“疾病环境”基础,他们构建了HaiDap筛选平台。
研究团队利用HaiDap系统,对来自22种可食用植物的提取物进行了大规模筛选,目的是从中找出能够有效抑制由iPSC来源的Aβ所诱导的蛋白聚集的天然抑制剂。作为对比,他们也使用了传统的、以磷酸盐缓冲液(PBS)为基础的体外聚集实验进行了平行筛选。结果凸显了新型系统的优越性:在PBS体系的筛选中,有40.9%(9/22)的提取物显示出了抑制活性,但这种基于简单生化环境的筛选假阳性率可能较高;而当使用更贴近疾病生理状态的iPSC条件培养基(即HaiDap系统)进行筛选时,显示活性的提取物比例大幅降低至13.6%(3/22),表现出更高的筛选特异性。这3种被HaiDap系统鉴定出的提取物分别来源于Orthosiphon aristatus、Syzygium aromaticum和Glehnia yesoense。
后续更为深入的验证实验表明,这3种提取物均能显著延缓Aβ在活神经元表面的聚集过程。这一结果在基于iPSC的细胞模型中得到证实,意味着这些天然化合物不仅在生化水平有效,在更接近真实神经元的环境中同样具有功能活性,进一步验证了HaiDap系统筛选结果的有效性和生理相关性。
本研究主要应用了以下几项关键技术方法:1. 诱导多能干细胞(iPSC)技术,使用一名男性阿尔茨海默病患者的细胞来源;2. HaiDap高通量筛选系统的构建,该系统核心是利用iPSC分化细胞的条件培养基模拟疾病环境;3. 基于可食用植物提取物的化合物库筛选;4. 以Aβ聚集为表型的检测方法;5. 使用iPSC分化的神经元进行后续的功能验证实验。
研究结果
开发HaiDap高通量筛选系统
研究人员成功构建了HaiDap(High-throughput screening technology for Aggregation Inhibitors of Diseased cell-derived Aggregative Proteins)系统。该系统利用阿尔茨海默病患者特异性iPSC分化后产生的条件培养基作为筛选基质,旨在模拟体内疾病环境,用于大规模筛选能够抑制由疾病细胞分泌的Aβ所引发聚集的化合物。
HaiDap系统筛选具有更高特异性
利用HaiDap系统对22种植物提取物进行筛选,并与传统的PBS体系筛选结果对比。PBS体系筛选出9种(40.9%)具有抑制活性的提取物,而HaiDap体系仅筛选出3种(13.6%),表明基于iPSC条件培养基的筛选能有效减少假阳性,具有更高的特异性。
鉴定出的抑制剂在神经元模型中有效
通过HaiDap系统鉴定出的三种植物提取物(分别来自O. aristatus、S. aromaticum和G. yesoense)在后续的验证实验中被证实,均能显著延缓Aβ在由iPSC分化的神经元细胞表面的聚集过程,证明了这些抑制剂在生理相关模型中的有效性。
结论与意义
该研究开发的HaiDap系统,成功在药物发现的早期筛选阶段,搭建了一座连接“高通量、低成本”与“高生理相关性”的桥梁。它通过创新性地使用iPSC疾病模型的条件培养基,既保留了患者特异性细胞所提供的病理环境信息,又规避了直接使用细胞进行大规模筛选的昂贵成本。该研究不仅成功地从天然产物库中特异性地鉴定出数个能有效抑制Aβ聚集的候选化合物,更重要的是,它验证了一种全新的筛选策略的可行性。研究表明,相较于传统简单体外模型,基于iPSC条件培养基的HaiDap系统能显著提高筛选的特异性,有助于在更早阶段剔除假阳性化合物,从而加速针对阿尔茨海默病等复杂疾病的新药研发进程,降低后续研发失败的风险。这项技术为未来针对其他由特定致病蛋白聚集引起的疾病(如帕金森病、肌萎缩侧索硬化症等)的药物筛选提供了可借鉴的通用性平台。