细胞游离蛋白质合成(CFPS)与表面等离子体共振(SPR)传感联用:一种针对跨膜蛋白CXCR4的原位、高通量药物筛选新策略

《Journal of Pharmaceutical Analysis》:In situ construction of an SPR biosensor using cell-free protein synthesis technology and its application in drug screening for CXCR4

【字体: 时间:2026年03月26日 来源:Journal of Pharmaceutical Analysis 8.9

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  本研究聚焦于解决表面等离子体共振(SPR)技术在针对跨膜蛋白(TMs)进行药物筛选时面临的蛋白质表达、纯化与固定难题。研究人员创新性地将细胞游离蛋白质合成(CFPS)技术与SPR生物传感器相结合,开发了一种针对C?X?C趋化因子受体4(CXCR4)的原位、一步式药物筛选新策略。该研究成功鉴定了甘草酸和人参皂苷Re为潜在的CXCR4抑制剂,并通过亲和力测定、分子对接和细胞迁移实验加以验证。此方法显著提升了SPR筛选跨膜蛋白靶向药物的效率和便捷性,为高通量药物发现提供了新工具。

在药物研发的战场上,科学家们急需一种能够快速、精准地“锁定”致病蛋白,并找到与之匹配“钥匙”(即药物分子)的先进工具。表面等离子体共振(SPR)技术正是这样一台“分子雷达”,它能够无标记、实时地检测生物分子间的相互作用,是药物筛选和分子识别研究的利器。然而,这台强大的“雷达”也有其软肋:它对“侦测目标”——蛋白质的纯度有着极高的要求。特别是对于许多镶嵌在细胞膜上、具有疏水性的跨膜蛋白(TMs),例如在癌症、艾滋病和炎症等多种疾病中扮演关键角色的C?X?C趋化因子受体4(CXCR4),其体外表达、纯化并保持天然活性结构是公认的巨大技术挑战。传统方法费力、耗时且成本高昂,严重限制了SPR技术在靶向这类“难缠”蛋白的药物筛选中的应用。
为了破解这一困局,海军军医大学的研究团队独辟蹊径,在《药物分析学报》(Journal of Pharmaceutical Analysis)上发表了一项创新性研究。他们巧妙地将“蛋白质合成车间”与“分子探测雷达”合二为一,构建了一个高效、便捷的药物筛选新平台。这个“车间”便是细胞游离蛋白质合成(CFPS)技术。它绕过了活细胞,直接在试管中利用细胞裂解液合成目标蛋白,尤其擅长生产那些难以在细胞内表达或具有毒性的蛋白。更重要的是,研究人员可以在合成蛋白时,直接给它“戴上”一个特殊的“身份标签”——组氨酸标签(His-tag)。
这项研究的核心思路在于:利用CFPS技术快速合成带His-tag的CXCR4蛋白,然后将这个包含了目标蛋白的复杂反应混合物,直接上样到SPR仪器的NTA(镍-氮川三乙酸)生物传感器芯片上。芯片上的镍离子(Ni2+)能像磁铁一样牢牢“吸住”His-tag,从而一步完成目标蛋白从混合物中的“原位纯化”和“固定化”。这彻底省去了传统方法中繁琐、易导致蛋白失活的多步纯化与偶联过程,将SPR实验流程大大简化。
研究人员为开展这项研究,主要整合运用了以下几项关键技术:首先是细胞游离蛋白质合成(CFPS)技术,用于快速制备带有组氨酸标签(His-tag)的目标跨膜蛋白(CXCR4)。其次是表面等离子体共振(SPR)传感技术,作为实时、无标记分析分子相互作用的平台,并使用了三种不同修饰的传感器芯片(CM5、CMD-NTA、HC-NTA)进行比较。在验证环节,他们运用了Western blot(蛋白质免疫印迹)以确认CFPS产物的正确合成。随后,对筛选出的候选化合物进行了细胞迁移实验(Transwell assay)以评估其生物学功能。最后,利用分子对接(Molecular docking)模拟了候选化合物与靶蛋白CXCR4的结合模式,从结构层面预测相互作用。研究中使用了一个包含96种天然产物的化合物库进行初步筛选。
研究结果
3.1. 利用CFPS技术合成CXCR4蛋白
研究人员成功设计并合成了带有His-tag的CXCR4表达质粒。通过Western blot分析,分别使用抗His抗体和抗CXCR4抗体进行检测,均在CFPS反应混合物中观察到了清晰的目的蛋白条带,证实了利用CFPS技术成功合成了具有免疫反应活性的CXCR4蛋白。
3.2. SPR生物传感器的固定策略
研究比较了三种不同的CXCR4蛋白固定策略:
  1. 1.
    传统策略:使用商品化的CXCR4病毒样颗粒(VLP),通过氨基偶联法固定在CM5传感器芯片上。
  2. 2.
    CFPS-NTA新策略1:将CFPS合成的CXCR4蛋白,通过其His-tag原位固定到羧甲基葡聚糖修饰的NTA(CMD-NTA)传感器芯片上。
  3. 3.
    CFPS-NTA新策略2:将CFPS合成的CXCR4蛋白,通过其His-tag原位固定到聚羧酸水凝胶涂层修饰的NTA(HC-NTA)传感器芯片上。
活性测试表明,三种策略构建的生物传感器均能有效结合已知的CXCR4抑制剂AMD3100,证明CFPS合成的蛋白具有与VLP蛋白相似的结合活性。其中,CMD-NTA策略因其良好的活性和响应,被选为后续药物筛选的平台。该策略的关键优势在于,它实现了目标蛋白的“一步式”原位纯化与固定,无需单独纯化步骤,也无需像VLP策略那样使用对照传感器扣除背景,操作更简便、快速。
3.3. 从天然产物中筛选CXCR4配体
利用构建的CXCR4-CFPS/CMD-NTA生物传感器,研究人员对一个包含96种天然产物的化合物库进行了初步筛选。通过比较相对响应值,初步筛选出8个潜在结合化合物。进一步的动力学结合分析确认,其中甘草酸、纤细薯蓣皂苷(gracillin)、人参皂苷Re和紫草素(alkannin)能与CXCR4发生特异性结合。
3.4. 两种化合物对细胞迁移的抑制作用
考虑到药物应用的潜在毒性,研究人员通过CCK-8实验评估了四种先导化合物的细胞毒性。结果显示,纤细薯蓣皂苷和紫草素在较低浓度下即表现出较强的细胞毒性。因此,后续功能实验聚焦于细胞毒性较低的甘草酸和人参皂苷Re。Transwell细胞迁移实验表明,这两种化合物均能以浓度依赖的方式有效抑制SH-SY5Y神经母细胞瘤细胞的迁移能力,提示它们可能具有抑制CXCR4介导的细胞迁移(一种与癌症转移相关的过程)的活性。
3.5. 两种化合物对CXCR4通路抑制的验证
通过实时荧光定量PCR(qPCR)检测下游基因表达发现,甘草酸能显著降低白细胞介素-4(IL-4)基因的表达,而人参皂苷Re能显著降低基质金属蛋白酶-9(MMP-9)基因的表达。这表明这两种化合物可能通过阻断CXCR4激活后的不同信号转导通路(如G蛋白或PI3K/Akt通路),来发挥其抑制功能。
3.6. 两种化合物与CXCR4的分子对接
分子对接模拟揭示了甘草酸和人参皂苷Re与CXCR4蛋白的结合模式。两者均表现出负的CDOCKER结合能,表明结合在能量上是有利的。甘草酸主要与PHE-189、VAL-196等氨基酸发生疏水相互作用,并与TYR-190、GLN-200形成氢键。人参皂苷Re则与ILE-204、LEU-208等多个疏水残基作用,并与GLN-200、TYR-256形成氢键。这些分子层面的相互作用预测,为两者的特异性结合提供了结构解释。
3.7. SPR验证
为了进一步确认新筛选平台的可靠性,研究人员使用另外两种生物传感器(CXCR4-VLP/CM5和CXCR4-CFPS/HC-NTA)对甘草酸和人参皂苷Re进行了亲和力测定。虽然不同传感器的响应信号强度有差异,但计算得到的亲和常数(KD)值在数量级上具有一致性,这交叉验证了CFPS-NTA策略所得筛选结果的可靠性和准确性。
研究结论与讨论
本研究成功地构建并验证了一个创新的高通量药物筛选系统。该系统创造性地整合了细胞游离蛋白质合成(CFPS)技术与表面等离子体共振(SPR)传感技术,实现了针对跨膜蛋白靶点的“原位纯化、一步固定、实时检测”。以CXCR4为模型靶点,该研究不仅证实了这一联合策略的可行性,还成功地从天然产物库中筛选出甘草酸和人参皂苷Re作为潜在的CXCR4抑制剂,并通过系列细胞和分子实验验证了其生物活性。
这项研究的重要意义在于,它巧妙地解决了SPR技术应用于跨膜蛋白药物筛选中的一个核心瓶颈——蛋白制备难题。CFPS技术快速、灵活地提供带标签的微量目标蛋白,而Ni-NTA-SPR芯片则高效地完成捕获与检测。这种“一体化”策略省去了繁琐的传统蛋白纯化与固定步骤,显著提高了实验效率,降低了技术门槛和成本,使得针对各类“难表达”跨膜蛋白的高通量筛选变得更为简便易行。研究所发现的CXCR4新型潜在抑制剂,也为后续抗肿瘤或抗转移药物的开发提供了有价值的先导化合物。
更重要的是,该平台具有广泛的普适性。通过更换CFPS系统中的目标基因和适配的传感器芯片/标签对(如GST标签等),此方法可轻松拓展至其他跨膜蛋白甚至可溶性蛋白的药物筛选工作中。未来,通过探索新的SPR固定策略、优化CFPS反应体系,并结合质谱(MS)、荧光成像等其他分析技术,该平台有望发展成为一个更加强大的多功能高通量筛选系统,为加速创新药物的发现进程提供强有力的技术支撑。

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