通过计算机模拟方法鉴定空肠弯曲菌（Campylobacter jejuni）中潜在的药物靶点，并评估草药化合物作为潜在抑制剂的潜力：采用减法蛋白质组学技术

《In Silico Pharmacology》：In Silico identification of a putative drug target in Campylobacter jejuni and assessment of herbal compounds as potential inhibitors: a subtractive proteomics approach

Campylobacter jejuni研究通过Schrodinger和分子动力学模拟发现脂多糖A二糖合成酶代谢靶点，证实与印度诺叶和 Fenugreek提取的Tinocordiside存在高亲和力，为新型抗菌药物开发提供依据。

摘要

Campylobacter jejuni是近几十年来最常见的病原体相关疾病。无论是在发展中国家还是发达国家，其发病率和普遍性都在上升。Campylobacter是食源性疾病的常见致病因子，每年导致约一百万例病例。这种细菌引起的感染可引发腹泻以及其他多种胃肠道问题。本研究旨在探索致病性C. jejuni的潜在药物靶点，并发现新的药物来抑制该病原体的活性。药物靶点的检测始于寻找与人类或肠道微生物群蛋白无同源性的靶点。这一过程包括识别关键蛋白质，确定那些与这些关键蛋白质有强烈相互作用并对维持蛋白质网络稳定性至关重要的蛋白质。随后会识别具有独特途径和已知分子功能的细胞质蛋白质，最后评估不可作为药物靶点的蛋白质。通过这种方法，我们发现了一个与脂质A二糖合成酶代谢相关的蛋白质靶点。这一发现是通过在DESMOND软件中进行薛定谔（Schrodinger）和分子动力学研究得出的。该药物靶点显示出与Tinocordiside（一种从Giloy植物中提取的天然化合物）以及Yuccagenin（葫芦巴种子中的成分）具有较高的结合亲和力。本研究认为，Yuccagenin这种天然化合物以及所识别的潜在药物靶点可以用于药物治疗，开发新型药物制剂以调节C. jejuni的生物活性，而C. jejuni正是导致食源性感染的病原体。

图形摘要

Campylobacter jejuni是近几十年来最常见的病原体相关疾病。无论是在发展中国家还是发达国家，其发病率和普遍性都在上升。Campylobacter是食源性疾病的常见致病因子，每年导致约一百万例病例。这种细菌引起的感染可引发腹泻以及其他多种胃肠道问题。本研究旨在探索致病性C. jejuni的潜在药物靶点，并发现新的药物来抑制该病原体的活性。药物靶点的检测始于寻找与人类或肠道微生物群蛋白无同源性的靶点。这一过程包括识别关键蛋白质，确定那些与这些关键蛋白质有强烈相互作用并对维持蛋白质网络稳定性至关重要的蛋白质。随后会识别具有独特途径和已知分子功能的细胞质蛋白质，最后评估不可作为药物靶点的蛋白质。通过这种方法，我们发现了一个与脂质A二糖合成酶代谢相关的蛋白质靶点。这一发现是通过在DESMOND软件中进行薛定谔（Schrodinger）和分子动力学研究得出的。该药物靶点显示出与Tinocordiside（一种从Giloy植物中提取的天然化合物）以及Yuccagenin（葫芦巴种子中的成分）具有较高的结合亲和力。本研究认为，Yuccagenin这种天然化合物以及所识别的潜在药物靶点可以用于药物治疗，开发新型药物制剂以调节C. jejuni的生物活性，而C. jejuni正是导致食源性感染的病原体。

图形摘要