综述:MicroRNAs作为儿童哮喘诊断与治疗生物标志物的系统评价与生物信息学分析

《Journal of Personalized Medicine》:MicroRNAs as Diagnostic and Therapeutic Biomarkers in Childhood Asthma: A Systematic Review with Bioinformatics Analysis Ahmed I. Alrefaey, Elena V. Vorobeva, Jamil Jubrail, Ibemusu Michael Otele, Mikaela Lee, Tilman Sanchez-Elsner, Syed Hasan Arshad, Ramesh J. Kurukulaaratchy and Mohammed Aref Kyyaly

【字体: 时间:2026年03月30日 来源:Journal of Personalized Medicine CS6

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  本系统综述通过梳理2011-2025年相关研究,深入探讨了微小RNA(miRNA)在儿童哮喘诊断、表型分型与严重度评估中的价值。研究确认了多个具有诊断潜力的miRNA(如miR-26a、miR-1),并借助生物信息学分析揭示了其靶向的枢纽基因(如TNF、IL5、IL13)和调控通路,为开发新型生物标志物和潜在治疗策略提供了线索。

背景
哮喘是一种以慢性气道炎症和气道高反应性为特征的慢性、异质性疾病,儿童发病率是成人的3-5倍。诊断5岁以下儿童哮喘尤其具有挑战性,目前尚无单一的金标准检测方法。非侵入性标志物如呼出气一氧化氮分数(FeNO)、血嗜酸性粒细胞和血清总IgE的诊断特异性有限。微小RNA(miRNA)是一类稳定的、小的非编码RNA,参与哮喘相关通路,在儿童哮喘中显示出作为诊断生物标志物和治疗靶点的潜力。
方法
研究人员遵循系统评价和荟萃分析优先报告项目(PRISMA)指南,系统检索了截至2025年3月19日发表的英文文献。研究筛选、数据提取和质量评估(使用QUADAS-2工具)由多名评审员独立完成。对鉴定出的差异表达miRNA进行了生物信息学分析,包括利用miRWalk 3.0等工具预测靶基因,通过STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,使用Cytoscape的CytoHubba插件识别枢纽基因,并利用药物-基因相互作用数据库(DGIdb)预测潜在治疗药物。
结果
1. 研究特征与差异表达miRNA谱
47项研究符合纳入标准,从中鉴定出58个差异表达的miRNA(31个上调,27个下调)。样本来源多样,包括血液及其成分(血清、血浆、外周血单核细胞等)、鼻灌洗液(NLF)、支气管肺泡灌洗液(BALF)、脐带血和呼出气冷凝物(EBC)。研究发现多个miRNA在多种生物体液中重复出现,例如miR-21、let-7a和miR-146a在血液、BALF和EBC中均被检测到,表明存在非局限于气道的、分散的miRNA反应。
2. miRNA的诊断性能
在评估诊断性能的miRNA中,多个显示出潜力。例如,全血中的miR-1曲线下面积(AUC)高达0.977;血清中下调的miR-26a的AUC为0.96,敏感性83%,特异性93%;血清中上调的miR-210-3p的AUC为0.92。miR-21、miR-196a2等也显示出中等诊断潜力。然而,目前证据仍不足以支持它们作为经过验证的诊断组合应用于临床。
3. miRNA与哮喘表型及严重度
一些miRNA的表达与哮喘严重度表型相关。例如,在淋巴细胞中,hsa-miR-193b在轻度哮喘中下调,而hsa-miR-497、let-7e和miR-98在中重度病例中上调。在血清中,miR-21、miR-146a-5p、miR-210-3p、miR-378和miR-196a2在不同严重度哮喘中均上调,而miR-98-5p则下调。血浆中的miR-126和miR-22在重度哮喘中上调,miR-26a在中重度哮喘中下调。
4. 早期生命miRNA与哮喘风险预测
脐带血miRNA谱分析揭示了可能与未来哮喘风险相关的早期生命标志物。例如,miR-149-5p在后续发展为持续性、暂时性或新发哮喘的儿童中上调;miR-99b-5p、miR-125a-5p、miR-200c-3p和miR-145-5p在暂时性和新发哮喘病例中上调。
5. 生物信息学分析与潜在治疗靶点
对58个差异表达miRNA的靶基因预测和功能富集分析显示,相关基因在细胞活化、白细胞激活、免疫系统过程等生物学过程中富集。KEGG通路分析中,哮喘信号通路最为显著。PPI网络分析鉴定出10个枢纽基因:TNF、IL1B、IL10、TLR4、CXCL8、IL17A、STAT3、IL13、IL5和TGFB1。药物-基因相互作用预测分析从DGIdb中鉴定出339种潜在治疗候选药物,经验证后确认了26种候选药物,其中包括已获批准的哮喘生物制剂,如美泊利单抗(mepolizumab)、贝那利珠单抗(benralizumab)。
讨论与结论
本综述系统梳理了儿童哮喘相关的miRNA生物标志物研究。尽管存在研究方法、人群和样本类型的显著异质性等局限性,但结果提示多个miRNA(如miR-21、miR-146a、miR-26a)是未来儿童哮喘表型分型和严重度评估的有希望的候选生物标志物。生物信息学分析将差异表达的miRNA与已知的哮喘病理生物学核心枢纽基因和通路联系起来,并预测了潜在的药物-基因相互作用,为理解miRNA在儿童哮喘中的作用机制和探索新的治疗策略提供了线索。然而,现有证据仍是探索性的,在临床应用前需要进行严格的外部验证、标准化研究,并与临床风险因素整合。将miRNA转化为临床应用还面临样本处理标准化、检测方法一致性等诸多挑战。总之,miRNA为儿童哮喘的精准诊断和治疗提供了新的可能方向,但其临床转化之路仍需扎实的后续研究铺就。

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