源头破局！Covaris 重新定义 FFPE 核酸提取

FFPE 样本是肿瘤临床诊断的核心金标准，却长期被核酸提取难题困扰 —— 降解严重、回收率低、完整性差，直接制约测序质量与临床精准度。

如何突破 FFPE 样本 DNA/RNA 提取瓶颈，让珍贵临床样本发挥最大价值？

Covaris 给出了高效解决方案，从源头提升 FFPE 核酸提取效率与完整性，为肿瘤精准诊断与高通量测序筑牢关键第一步。

01  AFA聚焦超声-脱蜡彻底

• 声波能量几何聚焦

• 非接触式传递

• 稳定的样本处理温度

基于AFA技术的主动脱蜡过程

石蜡去除效果极佳--优于传统化学方法

02  truXTRAC自动化提取方案

FFPE 核酸自动化提取方案，实现快速、高通量、结果稳定的核酸制备。

truXTRAC FFPE Total NA Auto96试剂盒

▪ 高通量自动化FFPE样品提取和纯化

▪ 无需刺激性强的有毒有机溶剂

▪ 兼容FFPE蜡卷和微量FFPE样本

▪ 高品质、高得率的核酸提取

▪ 每次可提取96个样本

▪ 适配仪器：Covaris R或L系列超声仪

03  自动化方案数据展示

1 RNA/DNA的得率和纯度

truXTRAC自动法提取的核酸得率与纯度均优于传统方法，且可实现与手动提取高度一致的效果。

1.1--RNA提取效果

truXTRAC自动提取和手动提取在Brain和Breast两种癌组织的RNA得率更优。

荧光定量法(Qubit)检测FFPE组织总RNA提取得率

Auto: CVR自动化； Manual:  CVR手动法； Competitor: 传统提取法

truXTRAC自动提取和手动提取的RNA纯度更好

230、260和280nm吸光度测定纯度（Nanodrop)

1.2--DNA提取效果

truXTRAC自动提取和手动提取在colon和Breast两种癌组织的DNA得率更优。

荧光定量法(Qubit)检测FFPE组织总DNA提取得率

Auto: CVR自动化； Manual:  CVR手动法； Competitor: 传统提取法

truXTRAC自动提取和手动提取的DNA纯度与传统法相当。

230、260和280nm吸光度测定纯度（Nanodrop)

2 RNA和DNA的质控

truXTRAC自动法提取核酸的质量均优于传统方法，且可实现与手动提取高度一致的效果。

2.1 RNA的可扩增性和DV200检测

 图左：RT-qPCR是衡量RNA完整性(解交联，平均片段长度)的指标，truXTRAC自动和手工提取的RNA的可扩增性都优于传统试剂提取的RNA。

 图右：truXTRAC自动和手工提取RNA的DV200值均大于25%，可以满足RNA测序。

2.2 DNA的可扩增性和片段长度分析

 图左：用KAPA QC试剂盒检测DNA的扩增率，三种提取方法KAPA QC值相似，说明DNA质量(长度、解交联等)相当。

 图右：用片段分析仪检测提取的DNA总片段长度，对于Colon组织，truXTRAC自动和手工提取的DNA长度更优。

利用truXTRAC和传统试剂提取的DNA进行AFA剪切测试，传统试剂提取的DNA剪切重复性较差。可能是由于不完全的解交联或洗脱的DNA含有杂质所造成。

04   自动化提取-配套设备

truXTRAC FFPE Total Auto 96 Kit 专为您的实验室设计。可以每一步都自动化，或者根据需要选择自动化步骤。

对于完全集成自动化的流程，您还需要如下设备和试剂：

• Covaris R或L系列聚焦超声仪

• 自动化液体工作站

• 96通道全自动螺旋盖样品管开/关盖仪

• 自动化兼容离心机

• 2台液体集成处理干式加热器

• 无核酸酶水，乙醇，异丙醇

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