多模态平台Glomage:实现斑马鱼和小鼠模型肾小球高内涵形态学与RNA谱分析的新突破

《Advanced Science》:Glomage: A Multimodal Platform for High-Content Morphological and RNA Profiling of Glomeruli in Zebrafish and Mouse Models

【字体: 时间:2026年04月17日 来源:Advanced Science 14.1

编辑推荐:

  为解决慢性肾病研究中肾小球高分辨率3D成像、足细胞定量及跨物种高通量分析的技术瓶颈,研究人员开发了多模态平台Glomage。该平台可在斑马鱼幼体和小鼠中实现肾小球的高通量分离、免疫荧光3D成像、足细胞自动化计数及高纯度RNA提取,首次系统性量化了斑马鱼幼体肾小球的足细胞数量,并在足细胞损伤模型中验证了药物NM_187的保护作用。该工作为肾小球病理机制研究与药物筛选提供了高效、跨物种的高内涵分析框架。

  
慢性肾脏病影响着全球超过8.5亿人,但目前有效的治疗策略仍然有限。作为肾脏的核心过滤单元,肾小球的结构与功能高度依赖于足细胞(podocyte)这种终末分化且几乎无法再生的细胞所构成的复杂三维结构。然而,足细胞的复杂形态使得对其进行规模化分析变得异常困难,这严重阻碍了针对肾脏疾病的药物研发进程。与此同时,现有的研究技术——无论是传统的组织切片(仅能提供二维“快照”),还是先进的全器官光片成像(耗时且设备要求高)——都难以在保持三维结构完整性的同时,实现高通量、可重复的分析。斑马鱼(zebrafish)幼体因其体积小、通体透明、基因操作便捷且肾脏结构与哺乳动物高度保守,成为研究肾脏发育与疾病的理想模型。但如何从大量斑马鱼幼体中高效、无损地获取完整的肾小球,并同步进行精细的形态学观察和分子生物学分析,一直是该领域亟待突破的技术瓶颈。
为攻克这些难题,研究人员开发了一个名为“Glomage”的跨物种高通量多模态平台。该研究发表在国际知名期刊《Advanced Science》上,旨在建立一套能够对斑马鱼和小鼠模型的肾小球进行大规模、高内涵三维形态分析与RNA谱分析的标准化流程。
为了开展此项研究,研究人员主要采用了以下几个关键技术方法:
首先,建立了高效的肾小球批量分离技术。对于斑马鱼,研究者使用了携带足细胞特异性表达绿色荧光蛋白(eGFP)或mCherry的转基因品系,通过机械震荡法(如Fast-Prep-24设备配合陶瓷珠)从大量经多聚甲醛(PFA)固定的幼体中快速释放出完整的肾小球,并利用荧光体视显微镜进行手动收集。对于小鼠,则采用已发表的筛网过滤结合差异粘附法从肾脏中分离出肾小球。其次,开发了适用于批量样本的免疫荧光染色与三维成像流程。将收集到的肾小球置于带有滤膜的细胞培养插片中,在24孔板内完成全套免疫染色,再将滤膜整体封片,通过共聚焦显微镜进行自动化、多倍率的图像采集,获得高分辨率的三维Z-stack数据。第三,引入了基于人工智能(AI)的图像定量分析。利用Imaris等软件,对三维图像中的足细胞核(通过内源性荧光蛋白扩散标记)进行自动分割、计数,并对肾小球体积、球形度等进行量化。最后,建立了高纯度肾小球RNA的提取与分子分析方法。对未固定的斑马鱼幼体进行温和解离,手动挑取肾小球后,使用单细胞RNA纯化试剂盒提取RNA,进而通过逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)和实时定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)分析足细胞特异性基因的表达变化。
研究结果
2.1 Glomage:高通量分离斑马鱼幼体肾小球
研究人员成功建立了从100只固定后的斑马鱼幼体中批量分离完整肾小球的流程。利用足细胞表达eGFP的转基因品系(Podo:GFP),通过优化固定与解(dissociation)参数,实现了对完整肾小球的高效释放与收集,平均每100只幼可得约68个完整肾小球,回收率约68%。
2.2 Glomage:用于幼体肾小球3D免疫荧光分析的平台
将经过斑马鱼冷冻切片验证的抗体应用于完整肾小球染色,成功实现了对足细胞裂孔隔膜蛋白(nephrin, podocin)、肾小球基底膜成分(laminin)、壁层上皮细胞标志物(Pax2a)及内皮细胞(Ehd3)等关键结构的三维可视化。结果表明,该在完整肾小球中同样能获得特异、可重复的染色效果,首次实现了对大量完整肾小球中多靶点结构的快速免疫标记。
2.3 Glomage:快速定量完整幼体肾小球足中足细胞总数
利用eGFP蛋白可自由入足细胞核的特性,结合AI图像分析, 对5天(5 dpf)的马鱼肾小球进行三维核分割与计数, 首次准确定量了其足细胞数量, 平均每个肾小球含有88.40个足细胞(SD: 13.23)。
2.4 Glomage:足细胞损伤模型中的足细胞定量
在硝唑尼(NFP)诱导的(FSGS)样足细胞损伤模型中,应用该平台进行定量分析。结果显示,NFP处理导致足细胞核体积显著减小、活足细胞数量约下降50%。而同时给予保护性小分子化合物NM_187共处理,可完全足细胞的丢失。
2.5 Glomage:健康与细胞肾小球的体积(volumetric)分析
2.5 在足细胞损伤, N处理还导了表达阳性足细胞质体积的显减少和肾小球球形度的下降, NM_187处理可恢体积复到接近对水平,在形学上验证了NM的保护作用。
2.6 : 高纯肾小球RNA的分离****
建立了从非固定幼体中提取鱼幼肾鱼分离高鱼幼体纯肾小球RNA的流程。RT-PCR和RT-q结果显, 分离肾鱼RNA高度富集了足细胞特异性基因(<n<nphs2)<
相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博

热点排行

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号