中国CIPA家系NTRK1基因新型及复发变异的鉴定与功能表征:拓展突变谱并解析NGF-TrkA信号通路基因型-表型关联

《European Journal of Neurology》:Identification and Functional Characterization of Novel and Recurrent NTRK1 Variants in Chinese Families With Congenital Insensitivity to Pain With Anhidrosis: A Combined Clinical, Genetic, and Functional Study

【字体: 时间:2026年04月27日 来源:European Journal of Neurology 3.9

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  为解决先天性无痛无汗症(CIPA)致病NTRK1变异谱不全及功能机制不清的问题,研究人员对中国4个CIPA家系开展基因测序与体内外功能实验,鉴定出7个变异(含2个新型),明确各变异破坏NGF-TrkA通路(糖基化、磷酸化、结合及下游信号)的具体步骤,建立基因型-表型关联,为精准诊断与个性化治疗奠基。

想象一下,如果一个人失去了痛觉,生活会变成什么样?对于普通人来说,疼痛是身体的一种保护机制,提醒我们远离危险。然而,患有先天性无痛无汗症(Congenital insensitivity to pain with anhidrosis, CIPA,又称遗传性感觉和自主神经病IV型,HSAN-IV)的患者,自出生起就无法感知疼痛,并且全身无汗。这听起来似乎像某种“超能力”,但实际上这是一种极为痛苦的常染色体隐性遗传罕见病。由于缺乏痛觉防护,患者经常会无意识地自我伤害,导致反复的骨折、感染甚至自残;而无汗则导致他们无法通过排汗调节体温,引发反复高热,严重时可危及生命,常伴有智力发育迟缓等问题。
目前研究已知,CIPA的罪魁祸首是NTRK1基因(编码神经生长因子NGF的高亲和力受体TrkA)发生了致病变异。NGF与TrkA结合后,会激活下游一系列至关重要的信号级联反应(如RAS-MAPK、PI3K-AKT和PLCγ/PKC通路),这对痛觉神经元的存活、分化及汗腺的神经支配至关重要。一旦TrkA功能丧失,这些神经元便会凋亡,从而导致痛觉消失和无汗症。
尽管NTRK1基因变异是明确的致病原因,但目前的困境在于:已报道的许多变异缺乏系统的功能验证,这极大地阻碍了对疾病机制的深入理解以及精准的基因诊断。特别是在中国人群中,某些特定变异(如深层内含子变异c.851-33 T > A)虽被广泛报道,但不同变异组合如何精确影响TrkA蛋白功能、进而导致不同严重程度的临床表型(基因型-表型关联),仍是一个巨大的谜团。为了填补这一空白,来自中国苏州大学附属儿童医院吴江院区(苏州市吴江区儿童医院)等机构的研究人员,针对4个中国CIPA家系展开了临床、遗传与功能的综合性研究,该成果最终发表在《European Journal of Neurology》上。
研究人员通过深入的体内外实验,不仅鉴定出NTRK1基因的新变异、拓展了突变谱,还精细地描绘出不同变异破坏NGF-TrkA信号通路的具体“作案步骤”,并成功将分子缺陷与患者的临床严重程度联系起来,为未来的个性化治疗奠定了坚实的理论与实验基础。
主要关键技术方法
研究人员首先招募了4个中国CIPA家系共13名成员(含5名患者),采集外周血提取基因组DNA,分别运用全外显子测序(WES)和全基因组测序(WGS)进行致病位点筛查,并结合Sanger测序验证家系共分离。随后,利用多种生物信息学工具(如SIFT、PolyPhen-2、AlphaMissense等)预测变异致病性与蛋白稳定性,并借助AlphaFold3进行TrkA蛋白3D结构建模。在功能实验层面,研究通过在HeLa和HEK293T细胞(无内源性NTRK1表达)中转染野生型及突变型NTRK1质粒,综合运用了Western blot(检测蛋白表达、糖基化、磷酸化及下游AKT信号)、PNGase F酶解、Co-IP(检测NGF配体结合能力)以及RNA测序(RNA-seq)与qPCR等技术手段。
3 结果
3.1 四个先天性无痛无汗症家系的临床表型与遗传学分析
研究共纳入5名CIPA患者(年龄6个月至12岁),均表现出无痛觉和无汗的核心症状,但临床严重程度不一,有的伴有骨折、反复发热、智力迟滞或自残等行为。遗传学分析在NTRK1基因(转录本NM_001012331.2)中鉴定出7个变异:4个错义变异、2个深层内含子变异和1个插入缺失(indel)变异。其中包括2个首次报道的新型变异:c.2285C > A(p.P762H)和c.1990_1993delinsTGCT(p.G664_M665delinsCL)。此外,c.632 T > A、c.851-33 T > A等为已报道变异。这些变异有的位于细胞外IgC1结构域,有的位于细胞内酪氨酸激酶结构域(TKD)。
3.2 基于生物信息学的NTRK1变异潜在致病效应分析
除已知功能的深层内含子变异外,研究对其余5个变异(4个错义,1个indel)进行了预测。几乎所有工具均预测这些变异具有破坏性(deleterious),且在人群数据库(ExAC、gnomAD等)中频率极低或为零。蛋白稳定性预测显示,这些变异普遍降低了TrkA蛋白的稳定性(ΔΔG值变化)。3D结构建模(AlphaFold3)进一步揭示,变异引起了局部氢键网络的显著改变(如新增或丢失特定氢键),从结构上解释了其对蛋白构象的潜在影响。
3.3 变异对蛋白表达及翻译后修饰的影响
Western blot结果显示,大多数变异蛋白表达水平与野生型相似,但c.632 T > A(p.V211E,位于胞外域)导致140 kDa的成熟糖基化TrkA蛋白完全消失;c.1942C > T(p.R648C)则显著降低了总TrkA水平,尤其是110 kDa的部分糖基化前体。NGF刺激实验表明,除c.632 T > A能保留部分磷酸化能力外,所有位于TKD的变异均完全阻断了TrkA的磷酸化(p-TrkA Tyr490),证明TKD变异严重损害受体的自磷酸化能力。
3.4 NTRK1变异对配体结合及下游通路激活的影响
Co-IP实验显示,所有突变型TrkA与NGF前体(proNGF)的结合能力均较野生型显著降低,部分变异也改变了proNGF与成熟NGF(mNGF)的比例。在下游信号方面,NGF刺激下的AKT磷酸化(p-AKT Ser473)在c.1942C > T、c.1990_1993delinsTGCT和c.2122G > A中完全消失;在c.632 T > A和c.2285C > A中显著减弱;而既往报道的c.2285C > T甚至表现出比野生型更强的磷酸化信号,暗示其可能存在非典型的信号调控。
3.5 RNA测序(RNA-Seq)揭示与CIPA表型、炎症及免疫相关的差异表达基因(DEGs)
RNA-seq分析发现,突变组与野生型组转录谱明显分开,共鉴定出140个DEGs。下调基因中包含多个神经元功能与发育关键基因(如NGF、AKNA、KCNS3、ADAT3、ATG4D)以及炎症调控因子MIF和骨再生相关基因EMILIN2。qPCR验证了这些基因的下调。GO和KEGG富集分析不仅捕捉到“酪氨酸激酶信号通路”、“蛋白磷酸化”等直接受损条目,还显著富集到“破骨细胞分化”及炎症免疫相关通路,为患者出现骨折易感及炎症倾向提供了分子解释。
3.6 NTRK1变异在多步骤上破坏NGF-TrkA信号通路从而解释痛觉缺失
综合上述实验,研究者提出一个精细的机制模型:野生型TrkA功能依赖正确的糖基化、NGF结合、受体二聚化、自磷酸化及下游信号转导。c.632 T > A(胞外域)主要破坏TrkA的正确糖基化;而位于TKD的变异(c.1942C > T、c.2122G > A、c.2285C > A及indel)则主要损害自磷酸化能力。尽管各有侧重,但所有变异均削弱了与NGF的亲和力,并最终阻断或削弱下游信号,导致NGF-TrkA通路功能丧失,引发CIPA。
4 讨论
4.1 导致CIPA的NTRK1变异的分子异质性
本研究再次印证了NTRK1变异类型的多样性。除了已知的深层内含子剪接变异,新发现的c.2285C > A和c.1990_1993delinsTGCT进一步丰富了突变库。值得注意的是,在家族4中,c.1942C > T和c.1990_1993delinsTGCT以顺式(cis)形式存在于同一条等位基因上,构成“双重激酶死亡”状态,虽未加重个体表型(因单个变异已足以完全阻断功能),但揭示了等位基因上变异叠加的分子细节。
4.2 基因型-表型关联提示CIPA临床严重程度取决于结构域及机制
研究观察到明显的基因型-表型等级关联:携带TKD变异(如c.2122G > A或c.1942C > T组合)的患者表型更严重(伴智力迟滞、反复高热等),因为这些变异在多节点(结合、磷酸化、下游信号)破坏通路;而携带c.632 T > A(胞外域,保留部分磷酸化与下游信号)或c.2285C > A(保留部分AKT信号)的患者,症状相对较轻。这强调了单纯基因检测不足以判断预后,必须结合功能表征。
4.3 在细胞过表达模型中TrkA优先与proNGF相互作用
Co-IP中仅检测到proNGF与TrkA结合,而未捕获mNGF,这可能源于HEK293T细胞内proNGF过量及缺乏p75NTR(NGF另一种受体)共受体。但核心结论不变:所有突变体结合proNGF的能力均显著弱于野生型,证明其配体 engagement 受损。
4.4 局限性
研究样本量较小(5名患者),且使用了非神经元细胞系(HeLa和HEK293T)。部分患者的临床随访时间较短,长远表型(如关节畸形)可能尚未显现。未来需在神经元模型(如iPSC来源神经元)中验证。
5 结论
综上所述,本研究在中国CIPA家系中鉴定出7个NTRK1变异(含2个新型变异),通过系统功能表征,精准定位了各变异在NGF-TrkA通路中破坏的具体步骤(从糖基化缺陷到信号转导阻断),建立了清晰的基因型-表型关联层级,不仅拓展了致病突变谱,更为CIPA的分子诊断及未来个性化治疗策略的开发提供了关键基石。

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