10x Genomics推出全新的Atera平台,让空间分析无需妥协

【字体: 时间:2026年04月28日 来源:生物通

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  这是一款全新的原位空间生物学平台,旨在以空前规模提供具有单细胞灵敏度的全转录组空间分析。

  

10x Genomics公司于4月18日在圣地亚哥的Hard Rock酒店举办了一场“Impossible”派对,宣布推出其新款原位空间平台——Atera。

这是一款全新的原位空间生物学平台,旨在以空前规模提供具有单细胞灵敏度的全转录组空间分析。该仪器在2026年美国癌症研究协会(AACR)的年会上首次亮相。

10x Genomics首席执行官Serge Saxonov博士指出,“我们需要观察的内容与我们能够测定的内容之间存在差距”。他表示,Atera能够实现大规模的全转录组空间分析,从而避免了在使用现有空间工具时通常需要的权衡取舍。

与10x的Xenium平台相比,Atera提供了更高的通量、多重性和灵敏度,可实现大规模的全转录组测序。具体来说,相较于Xenium,Atera的通量提高了4倍,靶向分析的多重性提高了6倍,全转录组分析的灵敏度提高了2-3倍。

Atera平台每年可分析多达800个1 cm2的全转录组样本(FFPE和新鲜冷冻样本),具有灵活的运行配置,每张载玻片的可成像面积大于5 cm2。在使用四张载玻片时,每次运行可分析的组织面积大于20 cm2

Atera WTA(全转录组)分析覆盖18,000个基因,可堆叠分析多达1,000个额外的定制基因。Atera Select基因组合可堆叠分析多达2,000个基因,未来还将支持3,000个基因的堆叠分析。

西班牙国家基因组分析中心的Holger Heyn教授表示:“具备全转录组分析能力的空间基因组学,是在组织背景下测定单个细胞的终极方法。其他所有多重性较低的方法都只是通往这一应用的热身阶段。”

圣裘德儿童研究医院的Jasmine Plummer博士指出,该仪器使用标准的玻璃载玻片,这令人兴奋。她表示,在过去与其他研究人员协作时,载玻片曾是一个难题,而使用常规载玻片将便于病理学应用。

在基因组学领域,空间技术仍然处于相对初级的阶段。人们需要在多重性、分辨率和通量之间做出权衡取舍。

转化基因组学研究所(TGen)的科学发展副总裁Nick Banovich博士表示:“在当今的技术格局下,这种权衡是不可避免的。越是接近全转录组测序,单个基因的灵敏度就越低。”

“Atera最令人兴奋的地方在于,它既能覆盖全转录组,又能保持相当高的灵敏度。这就是该系统的巨大优势,不再需要取舍,” 他谈道。

德国癌症研究中心(DKFZ)的研究人员在AACR年会上展示了数据,突出了Atera能够揭示传统方法无法触及的癌症生物学机制。

研究人员在单个结直肠癌样本中区分了不同疾病阶段的多种恶性细胞和干细胞状态,并绘制了这些细胞群与周围免疫微环境的相互作用图谱。这些数据揭示了更为复杂的免疫图谱,这有望为未来的治疗策略和药物开发提供重要信息。

10x Genomics表示,Atera将在推动大规模数据研究方面发挥重要作用。例如,随着人类细胞图谱(Human Cell Atlas)计划持续推进,Atera将助力该计划目标的实现。

参与人类细胞图谱计划的Heyn教授表示:“随着计划进入生成空间分辨率图谱的下一阶段,全转录组方法将成为数据生成的主力。我很高兴看到Atera平台已经推出,因为我们正在为人类细胞图谱2.0阶段全面提高产能。”

据10x Genomics公司介绍,Atera平台将于今年下半年上市,目前已开始接受订单。


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