基于下一代测序技术，在眼部附属器MALT淋巴瘤中未检测到衣原体感染

《Infectious Agents and Cancer》：Absence of chlamydial infection in ocular adnexal MALT lymphoma based on next-generation sequencing

摘要

目的

黏膜相关淋巴组织（MALT）的结外边缘区淋巴瘤可发生在多种结外部位，常与慢性炎症相关，而这种炎症往往由感染性因子引发。在某些地区，眼附属器（OA）MALT淋巴瘤与鹦鹉热衣原体（Chlamydophila psittaci，简称C. psittaci）有关。本研究旨在探讨包括C. psittaci在内的病原微生物在OA-MALT淋巴瘤中的作用。

方法

从17份经福尔马林固定、石蜡包埋的OA-MALT淋巴瘤样本中提取DNA。随后进行了下一代测序，并利用生物信息学工具分析测序数据，以检测非人类DNA，重点关注已知病原微生物（包括C. psittaci 6BC菌株及其他与淋巴瘤发生相关的细菌）的完整或部分基因组。

结果

大部分测序读段映射到人类基因组上。未检测到超过背景水平的C. psittaci 6BC或其他非人类病原微生物的完整或部分基因组，也未观察到微生物序列的显著富集现象。

讨论

这些结果表明，与某些西方研究人群不同，在日本，C. psittaci等感染性因子不太可能在日本OA-MALT淋巴瘤的发病机制中起主要作用。

结论

我们的分析表明，在日本，包括C. psittaci在内的病原微生物可能与OA-MALT淋巴瘤无关。

目的

黏膜相关淋巴组织（MALT）的结外边缘区淋巴瘤可发生在多种结外部位，常与慢性炎症相关，而这种炎症往往由感染性因子引发。在某些地区，眼附属器（OA）MALT淋巴瘤与鹦鹉热衣原体（Chlamydophila psittaci，简称C. psittaci）有关。本研究旨在探讨包括C. psittaci在内的病原微生物在OA-MALT淋巴瘤中的作用。

方法

从17份经福尔马林固定、石蜡包埋的OA-MALT淋巴瘤样本中提取DNA。随后进行了下一代测序，并利用生物信息学工具分析测序数据，以检测非人类DNA，重点关注已知病原微生物（包括C. psittaci 6BC菌株及其他与淋巴瘤发生相关的细菌）的完整或部分基因组。

结果

大部分测序读段映射到人类基因组上。未检测到超过背景水平的C. psittaci 6BC或其他非人类病原微生物的完整或部分基因组，也未观察到微生物序列的显著富集现象。

讨论

这些结果表明，与某些西方研究人群不同，在日本，C. psittaci等感染性因子不太可能在日本OA-MALT淋巴瘤的发病机制中起主要作用。

结论

我们的分析表明，在日本，包括C. psittaci在内的病原微生物可能与OA-MALT淋巴瘤无关。