用于自下而上蛋白质组学的反相C18分离介质的选择：包括分离选择性和携带特性在内的全多孔吸附剂的多因素比较

《Journal of Proteome Research》：Selection of Reversed-Phase C18 Separation Media for Bottom-Up Proteomics: Multifactor Comparison of Fully Porous Sorbents Including Separation Selectivity and Carryover Characteristics

杨大然|老英|维克托·斯派塞|若昂·保罗|雷内·P·扎埃迪|奥列格·V·克罗欣

生物化学与医学遗传学系，加拿大曼尼托巴省温尼伯市班纳泰恩大道745号，基础医学科学大楼336室，邮编R3E 0J9

在自下而上的蛋白质组学研究中，基于肽的整体保留性质、柱压、分离选择性及效率、鉴定到的肽的数量以及残留物统计情况，对七种常用的C18固定相进行了评估。在标准的0.1%甲酸-水-乙腈洗脱条件下，肽的保留率在约3.4%的乙腈浓度范围内有所不同，具体顺序如下：XSelect CSH C18 2.5 μm、Luna C18(2) 3 μm、PepMap RSLC C18 2 μm、Reprosil-Pur ODS-3 3 μm、Reprosil-Pur C18 AQ 3 μm、Magic C18 AQ 3 μm、XBridge BEH C18 2.5 μm。由于XSelect上带有正电荷基团，其保留率较低；而Luna C18(2)和PepMap C18的表现则可以用小孔径材料表面可及性的降低来解释。孔径大小是影响分离选择性的主要因素。唯一肽的鉴定数量受到肽的分离效率和保留率的影响。这些因素更有利于使用颗粒较小且保留率较高的吸附剂，例如XBridge BEH C18。Luna C18(2)和PepMap RSLC（孔径为100 ?）由于肽的保留率较低及分离效率不高，导致鉴定结果较少。