在马来西亚婆罗洲的沙巴州发现类似猫传染性轮状病毒的菌株

《Tropical Medicine and Health》：Identification of feline-like rotavirus strains in Sabah State of Malaysian Borneo

　　

摘要

与发达国家相比，低收入和中等收入国家的儿童面临更大的轮状病毒感染负担。马来西亚是一个中等收入国家；然而，与其他东南亚国家一样，关于轮状病毒的研究相对较少。为了了解病毒株的多样性，我们对马来西亚婆罗洲沙巴州Papar地区的4家医疗机构中的5岁以下儿童进行了研究，并在2020年至2021年间采集了样本。研究表明，在马来西亚沙巴地区检测到的病毒株是通过基因组间的重配（reassortment）产生的。重配是导致轮状病毒株多样性的进化机制之一。我们研究了一种具有较长RNA序列及特殊G6P[9]组合的轮状病毒。这种病毒株的基因型为G6-P[9]-I2-R3-C3-M3-A3-N2-T6-E3-H6，其核心骨架类似于AU1病毒株，并含有来自DS-1病毒株的某些成分，表明它是一种基因组间的重配病毒株。在11个基因片段中，有5个与猫源病毒株最为相似，2个与人类病毒株最为相似，其余的则属于人源-动物源混合病毒株。通过重配产生的新型轮状病毒可能会影响疾病的结局和疫苗接种工作。