在非生物胁迫下，对Plantago fengdouensis中热休克因子的全基因组鉴定与表达分析

《BMC Plant Biology》：Genome-wide identification and expression analysis of heat shock factors in Plantago fengdouensis under abiotic stresses

　　

摘要

Plantago fengdouensis是一种分布极其有限的稀有植物，它曾经在长江中部的岛屿上繁盛生长，这些岛屿每年都会经历洪水和高温的交替影响。针对多种植物的研究表明，热休克因子（HSFs）是调控植物对非生物胁迫反应的重要因子，同时也在植物生长发育的调节中发挥作用。然而，关于P. fengdouensis中HSF家族的研究还存在缺失。因此，在P. fengdouensis的基因组中共鉴定出30个< />，并将其分为三组（A、B和C组）。< />中的DNA结合域（DBD）是一个N端结构域，由 motifs 1、motifs 2和motifs 3组成，这一结构在所有< />中都高度保守。在< />中发现了14个片段重复序列，并且它们在进化过程中经历了强烈的纯化选择。有四对基因< />/PfHSFA8b、PfHSFA1c/PfHSFA1d、PfHSFB2b/PfHSFB2c和PfHSFA4c/PfHSFA4d在不同组织、水淹处理和热处理条件下始终表现出相同的表达模式。< />启动子上游探测到许多与光响应和植物激素响应相关的cis元件。大多数< />转录本的积累没有表现出明显的组织特异性，而< />在茎和花中特别丰富。PfHSFA6e和< />在水淹条件下上调；而在热胁迫下：PfHSFA6a-PfHSFA6f的表达受到抑制。此外，在热胁迫早期,PfHSFA3、PfHSF8a和< />的表达显著增加。共表达分析揭示了< />之间的关联，表明它们可能参与了生物钟调节、生长阶段转换和开花过程。研究结果表明，< />在P. fengdouensis这种两栖生活方式中适应水淹和高温交替条件的过程中发挥了不可或缺的作用。

Plantago fengdouensis是一种分布极其有限的稀有植物，它曾经在长江中部的岛屿上繁盛生长，这些岛屿每年都会经历洪水和高温的交替影响。针对多种植物的研究表明，热休克因子（HSFs）是调控植物对非生物胁迫反应的重要因子，同时也在植物生长发育的调节中发挥作用。然而，关于P. fengdouensis中HSF家族的研究还存在缺失。因此，在P. fengdouensis的基因组中共鉴定出30个< />，并将其分为三组（A、B和C组）。< />中的DNA结合域（DBD）是一个N端结构域，由 motifs 1、motifs 2和motifs 3组成，这一结构在所有< />中都高度保守。在< />中发现了14个片段重复序列，并且它们在进化过程中经历了强烈的纯化选择。有四对基因< />/PfHSFA8b、PfHSFA1c/PfHSFA1d、PfHSFB2b/PfHSFB2c和PfHSFA4c/PfHSFA4d在不同组织、水淹处理和热处理条件下始终表现出相同的表达模式。< />启动子上游探测到许多与光响应和植物激素响应相关的cis元件。大多数< />转录本的积累没有表现出明显的组织特异性，而< />在茎和花中特别丰富。PfHSFA6e和< />在水淹条件下上调；而在热胁迫下：PfHSFA6a-PfHSFA6f的表达受到抑制。此外，在热胁迫早期,PfHSFA3、PfHSF8a和< />的表达显著增加。共表达分析揭示了< />之间的关联，表明它们可能参与了生物钟调节、生长阶段转换和开花过程。研究结果表明，< />在

Plantago fengdouensis适应水淹和高温交替条件的过程中发挥了不可或缺的作用。