从孟加拉国番茄根际中分离出的一种潜在生物肥料菌株Priestia megaterium MHES4的基因组序列草图

《BMC Genomic Data》：Draft genome sequence of Priestia megaterium MHES4, a biofertilizer candidate isolated from tomato rhizosphere in Bangladesh

　　

摘要

目的

Priestia属近年来因其在促进植物生长方面的潜力而受到关注。为了研究其基因组特征和生物安全性，以便将其作为本土的、适应气候变化的生物接种剂在田间应用，我们对从孟加拉国拉杰沙希地区干旱易发生态系统中生长的番茄植物根际分离出的Priestia megaterium MHES4菌株的基因组进行了测序、组装和注释。

数据描述

P. megaterium MHES4的鸟枪法全基因组测序（WGS）得到的基因组组装数据显示，共有60个contig，总长度为5,267,048 bp，N₅₀为446,003 bp，G+C含量为37.9%。平均测序深度为127.58×，覆盖率达到100%。基因组完整性评估为97.43%，污染率为3.5%，证实了其较高的组装质量。共有5,484个蛋白质编码基因被注释出来。此外，还鉴定了5,445个蛋白质编码序列、28个tRNA和5个rRNA。功能分析发现了一些参与次级代谢物合成的基因簇，如植烯合成酶和α-淀粉酶，以及一个I型CRISPR-Cas系统。利用计算机工具进行的生物安全性评估未检测到任何毒力因子或可传递的抗生素抗性基因，表明该菌株在农业中具有潜在的安全使用性。总体而言，这一基因组资源为我们了解了P. megaterium MHES4在养分循环和适应根际环境方面的遗传潜力提供了宝贵信息。