基于多域方法设计新型针对Chandipura病毒的表面抗原疫苗

《Journal of Pharmaceutical Innovation》：A Multi-Domain Approach for Designing of Novel Epitopes-Based Vaccine Against Chandipura Virus

　　

摘要

Chandipura病毒（CHPV）属于弹状病毒科（Rhabdoviridae），由于其与急性脑炎爆发的关联，特别是对儿童的影响，构成了重大的全球健康威胁。该病毒具有高死亡率，并且在流行地区反复出现。由于目前缺乏获批的疫苗，因此迫切需要先进的策略来应对CHPV感染。在这项研究中，采用了综合方法，包括反向疫苗学、分子对接和分子动力学（MD）模拟，以识别用于CHPV疫苗设计的新表位。通过减法蛋白质组学分析，选择了四种蛋白质作为表位预测的目标：> YP_007641377.1 核壳蛋白、> YP_007641379.1 基质蛋白、> YP_007641380.1 糖蛋白和> YP_007641381.1 大蛋白，并对B细胞和T细胞进行了表位预测。预测得到的表位进一步接受了免疫信息学筛选，最终选出了八个用于疫苗构建的表位。这些表位通过GPGPG连接子连接，并通过EAAAK连接子与霍乱毒素B亚单位（CTB）佐剂结合，以提高疫苗的功效。该疫苗构建体还进行了结构预测和生物物理学研究。在分子对接分析中，最佳对接相互作用由加权得分和最低能量值决定。值得注意的是，在MHC-I疫苗的情况下，第12簇显示出最优异的结合性能，其能量值为-838.0 kcal/mol；在MHC-II疫苗的情况下，第7簇表现出最稳定的相互作用，能量值为-948.7 kcal/mol；而在TLR-4疫苗的情况下，第4簇显示出最优异的结合性能，其加权得分和能量值均较低，为-1175.3 kcal/mol，表明其相互作用非常稳定。此外，还通过分子动力学（MD）模拟分析了对接分子的动态行为。模拟分析表明，在50个模拟周期内，疫苗构建体与目标受体的结合亲和力保持稳定。