低基因表达区域有助于维持和适应酵母中水平获得的基因

《Communications Biology》：Regions of low gene expression promote maintenance and adaptation of horizontally acquired genes in yeasts

　　

摘要

我们之前的研究表明，属于Starmerella和Wickerhamiella属（W/S支系）的酵母，其水平基因转移（HGT）事件的数量远高于其他任何酵母物种，这些转移的供体主要来自细菌和其他真菌（Pezizomycotina门）。在本研究中，我们通过对三个物种中的异源基因进行表征，进一步分析了W/S支系中的HGT现象。这些物种共携带了近600个异源基因。代谢基因在这些异源基因中占比显著较高，它们要么为酵母引入了新的功能，要么恢复了W/S支系祖先中可能缺失的功能。RNA测序结果显示，在两个物种中，异源基因的表达水平总体上低于本地酵母基因。这种差异与异源基因优先积累在富含AT序列的染色体末端区域（称为“End”结构域）有关，这些区域的基因表达水平通常较低。在其中一个物种中，我们发现“End”结构域更有利于蛋白质的多样化，但仅限于异源基因。我们认为，“End”结构域可能为异源基因的适应和保留创造了有利条件，从而解释了W/S支系中异常丰富的HGT事件。

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