脊髓损伤患者血浆蛋白质组的生物信息学分析：重点关注肝脏相关成分 莫根·戈德温（Morgan Godwin）、 莎伦·J·布朗（Sharon J. Brown）、 加布里埃尔·马特乌斯·伯纳多·哈林顿（Gabriel Mateus Bernardo Harrington）、 斯里尼瓦萨·C·布迪蒂（Srinivasa C. Budithi）、 约翰·S·里德尔（John S. Riddell）、 夏洛特·H·赫尔姆（Charlotte H. Hulme）以及 卡丽娜·T·赖特（Karina T. Wright）

《Livers》：Bioinformatics Analysis of the Spinal Cord Injured Plasma Proteome: A Focus on the Liver Morgan Godwin, Sharon J. Brown, Gabriel Mateus Bernardo Harrington, Srinivasa C. Budithi, John S. Riddell, Charlotte H. Hulme and Karina T. Wright

　　

摘要

背景：越来越多的证据表明，肝脏在脊髓损伤（SCI）的病理生理学过程中起着关键作用。方法：本研究利用生物信息学方法以及文献和数据库搜索，重新分析了来自大鼠模型和SCI患者的已发表的蛋白质组数据集。目的是识别SCI血液样本中肝脏特异性的分子特征，并将这些特征与不同时间点（急性期/亚急性期和慢性期）的损伤严重程度和神经功能恢复情况联系起来。 结果：在多个物种中，大量与损伤严重程度和神经功能恢复相关的蛋白质与肝脏功能相关。值得注意的是，那些病情没有改善的患者表现出持续的亚急性炎症反应。这些变化不仅限于经典的急性期反应物，还反映了肝脏代谢和合成途径的协调性改变。通路分析一致显示，肝X受体/维甲酸X受体（LXR/RXR）、补体系统/级联反应以及DHCR24信号通路与恢复状态有关。研究还鉴定出若干蛋白质，并将其归类为肝脏功能障碍、代谢功能、补体/凝血因子和/或急性期蛋白质的标志物。Alpha-2-HS-糖蛋白（AHSG）和afamin（AFM）在多个物种的数据集中出现异常表达，表明它们在炎症和脂质代谢中具有保守的作用。此外，还发现了这些蛋白质与肝脏病理（如纤维化和肝硬化）的关联，尤其是在病情没有改善的患者中。 结论：本研究基于越来越多的证据，证实了肝脏在SCI中的参与作用，提供了跨物种的、时间分辨的蛋白质组学支持，证明了损伤后肝脏相关蛋白质表达的变化。总体而言，这些发现强调了肝脏反应在SCI中的核心作用，指出了与肝脏相关的蛋白质和通路作为潜在的生物标志物，有助于分层评估患者的恢复路径并指导临床预后。