一种新型的针对FAK的降解剂:设计、合成及其在治疗结直肠癌方面的潜力

《Bioorganic Chemistry》:A novel FAK-targeted degrader: Design, synthesis, and therapeutic potential against colorectal cancer

【字体: 时间:2026年05月10日 来源:Bioorganic Chemistry 4.7

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  张荣洪 | 何海东 | 熊倩倩 | 张旭 | 赵永龙 | 严国毅 | 李永军 | 周萌国家重点实验室(中医功能成分发现与利用),教育部民族医药与中医药发展与应用工程技术研究中心,贵州医科大学药学院,贵州省贵安新区,561113,中国摘要 focal adhesion kinase

  
张荣洪 | 何海东 | 熊倩倩 | 张旭 | 赵永龙 | 严国毅 | 李永军 | 周萌
国家重点实验室(中医功能成分发现与利用),教育部民族医药与中医药发展与应用工程技术研究中心,贵州医科大学药学院,贵州省贵安新区,561113,中国

摘要

focal adhesion kinase (FAK) 在结直肠癌 (CRC) 中经常过表达,并在肿瘤进展中起关键作用,因此成为了一个有吸引力的治疗靶点。尽管 FAK 抑制剂能有效抑制其激酶活性,但它们无法阻断其非酶活性功能。大多数报道的针对 FAK 的蛋白水解嵌合体 (PROTACs) 主要关注优化降解效率,往往对 FAK 的“弹头”本身关注较少。本文设计并合成了一系列新的 FAK 靶向 PROTACs,通过对弹头部分和连接体组成的系统优化来实现。其中,化合物 16g 表现出最强的降解能力,在 HCT116 结直肠癌细胞中的 IC50 值为 1.56 μM,同时对正常 L02 细胞无细胞毒性。Western blot 分析证实 16g 能够诱导 HCT116 细胞中 FAK 蛋白的剂量依赖性降解。此外,16g 显著抑制了细胞群形成,并通过抑制 HUVEC 细胞增殖表现出抗血管生成活性。这些发现表明 16g 是一种新型且有效的 FAK 降解剂,对结直肠癌具有治疗潜力。

引言

结直肠癌 (CRC) 是消化系统中最常见的恶性肿瘤之一,是全球癌症相关死亡的第三大原因 [1]。尽管靶向治疗带来了生存益处,但其广泛应用仍受到目标范围有限、复杂的耐药机制和肿瘤微环境干扰等挑战的严重阻碍 [2], [3]。这种情况迫切需要开发新的靶向疗法来改善 CRC 的治疗效果 [4], [5]。
focal adhesion kinase (FAK) 是一种非受体细胞内酪氨酸激酶,在肿瘤进展中通过调节关键细胞过程(包括增殖 [6]、粘附 [7]、迁移 [8]、侵袭 [9] 和肿瘤细胞的血管生成 [10])发挥关键作用。FAK 的表达和磷酸化介导的激活在原发性和转移性肿瘤中均常上调,而抑制 FAK 活性已被证明能有效抑制肿瘤生长 [11], [12]。在 CRC 中,FAK 表现出异常过表达,其失调与肿瘤增殖和转移密切相关 [13]。因此,药理学抑制 FAK 激酶活性是治疗 CRC 的一种有前景的策略 [14], [15]。迄今为止,大多数报道的 FAK 抑制剂都是 ATP 竞争性抑制剂,它们以嘧啶环作为母体骨架(红色部分),并在两端引入各种取代基(图 1A)[16], [17], [18]。
Defactinib 已进入二期临床试验,但存在疲劳、恶心和腹泻等不良反应 [19]。因此,它通常与其他抗癌药物联合使用以提高治疗效果 [20],例如与 RAF/MEK 抑制剂 Avutometinib 合用治疗复发性低级别浆液性卵巢癌 [21]。除了基于嘧啶的骨架外,还开发了针对 focal adhesion domain(I,图 1A)和 ATP 结合口袋外的变构位点(II)的化合物,但由于效力不足,尚未进入临床开发 [14], [22]。在我们之前的工作中,化合物 12f (III) 被证明是一种有效的 FAK 激酶抑制剂(IC50 = 1.87 nM),并显示出强大的抗胰腺癌活性;然而,其体内疗效仍有待提高 [17]。
尽管 ATP 竞争性激酶抑制剂对 FAK 激酶表现出强大的抑制作用,但它们无法消除 FAK 的支架功能 [23]。具体来说,定位于细胞核的 FAK 可以作为支架与 p53 和 MDM2 相互作用,促进 p53 的降解,从而促进肿瘤进展 [24]。因此,合理设计 FAK 靶向剂不仅需要提高选择性,还需要消除 FAK 的支架功能,以完全抑制 CRC 中的 FAK 活性 [25]。
蛋白水解嵌合体 (PROTACs) 是具有双功能性的分子,它们将目标蛋白招募到细胞泛素-蛋白酶体系统中,导致其选择性降解和功能丧失 [26]。这种催化机制使 PROTAC 技术相比传统的占据驱动抑制剂具有明显优势,包括能够靶向以前“无法成药”的蛋白质并克服获得的药物耐药性 [27]。鉴于 FAK 抑制的治療前景,已经开发了几种基于 PROTAC 的 FAK 降解剂 [28], [29]。然而,由于所使用的 FAK 靶向弹头的固有限制,这些现有的降解剂仍然会对其他激酶产生显著的脱靶效应(图 1B)[30], [31], [32], [33]。这些发现表明,PROTAC 对 FAK 降解的选择性仍然是一个关键挑战,需要进一步优化。
本文从我们先前报道的 FAK 抑制剂 12f [18] 出发,设计并合成了新的 FAK 靶向 PROTACs。通过结合模式分析优化了抑制剂骨架,并通过多种连接体将活性显著提高的弹头与 E3 连接酶配体结合,构建了一个专注的 PROTAC 文库。系统筛选这些分子在结直肠癌细胞中的抗增殖活性和 FAK 降解效果,发现化合物 16g 是一种高效且选择性的 FAK 降解剂,具有治疗潜力。

章节片段

对 FAK 抑制剂 TAE226 的结合模式分析(图 2A)表明,它由三个不同的结构部分组成:一个中央的嘧啶环(部分 A),该环与激酶铰链区域的 Cys502 形成氢键;一个朝向 DFG 动机的取代环(部分 B);以及一个位于溶剂可及区域的额外环(部分 C)[34]。TAE226 通过中央嘧啶环的 N1 氮原子和亚胺与激酶铰链区域结合

所有试剂和化学品均从商业供应商处购买并按原样使用。1H 和 13C NMR 光谱是在 JEOL 400 MHz 光谱仪上记录的,使用 CDCl3 或 DMSO-d6 作为溶剂,四甲基硅烷 (TMS) 作为内标。高分辨率质谱 (HRMS) 是使用 Thermo Scientific Q Exactive Plus Orbitrap 质谱仪和 LC-MS/MS 系统进行的。熔点测定是在 WRS-2 微计算机熔点仪上完成的。

甲基

张荣洪: 数据整理。何海东: 原稿撰写。熊倩倩: 验证、概念构思。张旭: 可视化。赵永龙: 方法学研究。严国毅: 验证。李永军: 项目管理。周萌: 编写、审阅和编辑。

作者声明没有已知的财务利益或个人关系可能会影响本文报告的工作。

国家自然科学基金(82560679, 82403718)、贵州省科学技术厅(YQK[2023]031, qiankehejichu-ZK [2024]zhongdian038, MS[2026]524, KXJZ[2024]004, CXPTXM[2025]010/[2025]021/KXJZ[2025]014, ZSYS[2025]019)、贵州医科大学(GMUSKL-202539)、贵州省卫生健康委员会科学技术基金项目(gzwkj2026-046/gzwkj2026-477)、Qiankehe 平台(项目编号……)的支持

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