非小细胞肺癌中的miR-1260-ZNF轴：重点研究ZNF302、ZNF439和ZNF781

《Computational Biology and Chemistry》：The miR-1260-ZNF Axis in Non-Small Cell Lung Cancer: Focus on ZNF302, ZNF439, and ZNF781

　　

刘 Jun | 杨 Hui | 王嘉轩

江西九江九江学院基础医学院，邮编332000，中国

摘要

非小细胞肺癌（NSCLC）是癌症相关死亡的主要原因之一，因此需要寻找新的生物标志物以用于早期检测和治疗干预。在这项研究中，我们探讨了miR-1260与锌指（ZNF）家族基因在NSCLC微环境中的调控相互作用，以确定它们作为诊断和预后指标的作用。通过对GEO数据库中的公共数据进行生物信息学分析，系统地评估了miR-1260和ZNF基因的表达模式及其预后意义。我们使用了GEO 2R和Weishengxin平台等工具进行数据处理和可视化，构建了一个全面的miRNA-mRNA调控网络。结果表明，与正常组织相比，NSCLC组织中的miR-1260和ZNF基因具有独特的表达谱，并且与患者的生存结果显著相关。这些发现不仅突显了miR-1260和ZNF基因作为诊断生物标志物的潜力，还表明针对这些基因的治疗策略可能为NSCLC的管理提供新的途径。本研究强调了miR-1260-ZNF调控轴在NSCLC发病机制中的重要性，使其成为诊断、预后和进一步临床验证的有希望的候选分子。未来的研究应重点关注机制探索和大规模临床试验，以便将这些发现转化为改进的肿瘤治疗方案。

章节摘录

引言

在中国，呼吸系统疾病表现出强烈的群体特异性遗传异质性。最近的研究发现了与中国人群结核病易感性相关的关键遗传多态性，这突显了区域遗传变异对肺部健康的深远影响（Chen等人，2019年）。与传染性肺病的这些发现类似，非小细胞肺癌（NSCLC）也是由一系列遗传和表观遗传改变驱动的（Siegel等人，2021年）。

miRNA表达分析

在GEO数据库中搜索了“NSCLC”和“microRNA”这两个术语，找到了包含179个病例的数据集GSE102286。接下来，使用在线分析工具GEO 2R将这179个病例根据其恶性程度分为癌组织组（T，91例）和正常组织组（N，88例）。然后立即对这些组进行数据分析，并使用omic studio工具创建了基因表达差异图。

NSCLC中miRNA表达的预后价值

为了进一步分析...

在NSCLC中，11种miRNAs的表达显著增加，而18种miRNAs的表达显著减少。NSCLC组织中的miR-1260表达低于正常组织（见图1和补充表1）。

LUAD患者中miR-21表达低和miR-218表达高（P=0.043，HR=0.77）、miR-126（P=0.015，HR=0.68）、miR-1（P=0.01，HR=0.63）和miR-30a（P=0.021，HR=0.66）与较好的预后相关，而miR-193b表达低（P=0.047，HR=1.35）则与较差的预后相关。

迄今为止，尚未有关于不同亚型NSCLC中miR-1260-ZNF家族成员调控网络的研究报道，关于miR-1260、ZNF302、ZNF439和ZNF781与癌症关联的文献也不多。在这项研究中，我们全面探讨了不同亚型NSCLC中miR-1260-ZNF家族成员的转录谱、预后价值、功能富集和免疫浸润情况。

结论

本研究存在一些局限性。首先，miR-1260-ZNF家族网络内的调控相互作用是从在线公共数据库中推断出来的，需要通过实验方法进行验证。此外，阐明ZNF家族对NSCLC免疫浸润的影响还需要通过体内和体外实验模型进一步研究。

总之，我们的研究介绍了miR-1260-ZNF家族调控网络的构建。

资金支持

本研究得到了九江基础研究项目（项目编号S2024KXJJ001）的支持。

CRediT作者贡献声明

杨 Hui：撰写——原始草案、方法学、正式分析、数据管理。王嘉轩：正式分析、数据管理。刘 Jun：撰写——审稿与编辑、项目管理和资金筹集。

作者声明，本研究是在没有任何可能构成利益冲突的商业或财务关系的情况下进行的。

致谢

无