恶性疟原虫（Plasmodium falciparum）药物敏感性的跨境分子流行病学研究：从乌干达与刚果民主共和国边境地区获得的见解

《Malaria Journal》：Cross-border molecular epidemiology of Plasmodium falciparum drug susceptibility: insights from the Uganda–Democratic Republic of the Congo border

　　

摘要

背景

跨境寄生虫的传播加速了地方性地区抗药性的出现。在乌干达，具有青蒿素部分抗性的恶性疟原虫（Plasmodium falciparum）较早出现并迅速传播，成为监测的重点。在刚果民主共和国（DRC）东北部——这个与乌干达接壤的关键贸易走廊地区，我们研究了青蒿素部分抗性和对青蒿素联合疗法（ACTs）中使用的辅助药物的抗性的分子标记。在DRC监测这些抗性标记对于指导区域控制工作至关重要。

方法

2023年5月至6月期间，我们在20个村庄和一家中央医院分别进行了主动和被动疟疾病例检测。分子分析包括对pfmdr1和pfpm2/3基因的拷贝数变异（CNV）检测，以及对pfkelch13、pfmdr1和pfcrt基因的基因分型。对于pfmdr1的CNV检测，我们采用了最近为频繁发生多克隆感染的寄生虫群体提出的1.4的定量实时PCR阈值。我们对医院提供的样本进行了全基因组测序（WGS），以评估寄生虫的亲缘关系并追踪抗性的传播。

结果

在从村庄中采集的536名样本中，49.8%的样本通过PCR检测出恶性疟原虫（P. falciparum）阳性。pfmdr1的N86等位基因是固定型的，50.3%的样本携带NFD单倍型（氨基酸位置86、184和1246），这一标记与非洲地区对氯喹的敏感性降低有关。使用常规阈值（≥1.5）时，有4.4%的样本检测到pfmdr1的CNV；而使用1.4的阈值时，这一比例上升至11.7%。可能影响哌喹敏感性的pfpm2/3 CNV在7.0%的样本中被检测到。经验证的与青蒿素部分抗性相关的pfkelch13突变A675V和C469Y分别在4.3%和1.3%的村庄样本中被检测到。全基因组测序（WGS）的数据主成分分析显示，携带A675V或C469Y的DRC寄生虫与乌干达的寄生虫株群紧密聚集，这支持了抗性寄生虫在DRC和乌干达之间的跨境传播。

结论

我们的研究发现，刚果民主共和国东北部存在与青蒿素部分抗性和对氯喹敏感性降低相关的分子标记，并且有证据表明寄生虫从乌干达跨境迁移。鉴于氯喹和阿莫地喹对pfmdr1和pfcrt的相反选择压力，可以考虑进一步评估其他类型的青蒿素联合疗法（如青蒿琥酯-阿莫地喹）。为了维持青蒿素联合疗法的效果，综合性的基因组监测、临床监控和协调的区域政策响应至关重要。