循环T细胞和肿瘤微环境特征与肉瘤免疫检查点阻断治疗结果的关联 可供购买

《Clinical Cancer Research》：Association of Circulating T Cell and Tumor Microenvironment Profiles with Immune Checkpoint Blockade Outcomes in Sarcoma Available to Purchase

　　```

摘要

目的：

免疫检查点阻断（ICB）仅对部分肉瘤患者有益。需要确定响应和抵抗的生物标志物，以帮助指导患者选择。

实验设计：

我们分析了在五项基于ICB的临床试验中治疗的肉瘤患者的外周血和肿瘤样本。基线外周血单核细胞（PBMC）通过11色流式细胞术分析了T细胞免疫类型。基线肿瘤组织通过RNA测序（RNA-seq）使用29个功能性基因表达特征的共识聚类将肿瘤分为四种肿瘤微环境（TME）亚型。评估了免疫特征与临床结果之间的关联。对于有可用RNA-seq的患者，应用深度学习模型检测和量化H&E切片中的淋巴细胞聚集。

结果：

在178名有PBMC可供分析的患者中，增殖型（PRO）循环T细胞免疫类型与较差的总体生存率（OS）相关，而淋巴细胞激活基因3（LAG）^?或LAG⁺免疫类型则没有这种关联。对67个肿瘤的RNA-seq分析发现，免疫富集/非纤维化TME亚型与更高的响应率、更长的无进展生存期和更长的OS相关，相比之下，免疫贫乏和纤维化亚型的生存情况较差。对48张基线H&E切片的自动化分析在5个肿瘤中检测到淋巴细胞聚集；其中4个被归类为免疫富集型，其中2个对ICB有反应。

结论：

具有PRO循环T细胞免疫类型的肉瘤患者的预后较差，而具有免疫富集/非纤维化TME的患者预后较好。H&E切片的自动化分析在识别免疫富集TME的患者方面显示出潜力。这些发现支持使用多模态方法来识别肉瘤对免疫治疗的反应预测因子。

数据可用性

同意数据共享的192名MSK患者的RNA-seq数据可通过基因型和表型数据库公开获取（访问编号：phs003284）。斯坦福队列的大部分RNA-seq数据可在GSE213065获取。SARC028数据集可根据研究需求提供（[e-mail]），通过SARC临床试验数据存储库：https://sarctrials.org/clinical-trials/sarc028/。流式细胞术和自动H&E分析数据在数据补充材料中提供。

```