《Journal of Infection and Chemotherapy》：Respiratory viruses in adult community-acquired pneumonia identified by a multiplex PCR panel: a single-center retrospective study
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松村隆马 | 铃木惠子 | 宫家宏树 | 笠贺健太郎 | 道脇隆弘 | 堀翔太 | 伊藤康辅 | 小野正和东京罗斯爱医院呼吸内科，日本东京大田区大森南4-13-21，邮编143-0013摘要背景非流感和非SARS-CoV-2呼吸道病毒越来越多地被认为是成人社区获得性肺炎（CAP）
松村隆马 | 铃木惠子 | 宫家宏树 | 笠贺健太郎 | 道脇隆弘 | 堀翔太 | 伊藤康辅 | 小野正和
东京罗斯爱医院呼吸内科，日本东京大田区大森南4-13-21，邮编143-0013
摘要
背景
非流感和非SARS-CoV-2呼吸道病毒越来越多地被认为是成人社区获得性肺炎（CAP）的病因，但它们在常规临床实践中的分布情况仍不清楚。
方法
这项单中心回顾性研究包括了2023年3月至2025年12月期间通过影像学确诊为肺炎的成人门诊患者，这些患者接受了鼻咽部多重PCR检测（FilmArray Respiratory Panel 2.1）。检测结果对至少一种目标病毒呈阳性的病例被纳入分析，排除了流感病毒和SARS-CoV-2。研究人员分析了病毒分布和每月病例数，并探讨了与多重病毒阳性相关的因素。
结果
在834次检测中，有199次对至少一种目标病毒呈阳性，其中161例通过影像学确诊为肺炎。在161次病毒检测中，153例为单病毒阳性，8例为多重病毒阳性。人类鼻病毒/肠道病毒（HRV/EV）是最常检测到的病毒（36.1%），其次是人类偏肺病毒（hMPV，18.3%）、副流感病毒（PIV，17.8%）和呼吸道合胞病毒（RSV，16.6%）。探索性分析显示，病毒分布存在显著的月度变化（Monte Carlo χ2检验，p < 0.0001）。在单病毒阳性病例中，RSV和季节性冠状病毒之间的年龄差异显著（p = 0.030），PIV和RSV之间的性别分布也存在差异（p = 0.019），PIV和HRV/EV之间的性别分布也存在差异（p = 0.037）。尽管多重病毒阳性较为罕见，但在多变量分析中，它与较年轻的年龄独立相关（OR = 0.96，p = 0.041）。
结论
在常规CAP实践中，检测到了多种非流感和非SARS-CoV-2呼吸道病毒，并且存在明显的季节性变化。多重病毒阳性较为罕见，且与较年轻的年龄相关。
引言
社区获得性肺炎（CAP）在成人中是一种常见疾病，确定致病病原体在临床上非常重要，因为它会影响治疗决策和感染控制措施。最近的系统评价显示，大约22%–29%的成人CAP病例中检测到了呼吸道病毒[1]，这表明病毒是该疾病的主要病原体之一。然而，CAP中的病毒检测并不一定意味着单一病原体感染。在一项针对CAP患者的报告中，24.9%的病例的痰液样本中检测到了细菌病原体（病毒-细菌共感染），2.7%的病例同时检测到了两种呼吸道病毒（多重病毒感染）[2]。因此，成人CAP的病原体谱具有异质性。这种异质性使得关于抗生素使用和感染控制的决策变得复杂，强调了描述常规实践中病毒检测实际模式的临床价值。
尽管已知病毒在成人CAP中的作用，但历史上对成人呼吸道病毒的诊断检测一直有限。目前广泛可用的是快速流感抗原检测和SARS-CoV-2的抗原及PCR检测；然而，其他呼吸道病毒在常规护理中的检测频率要低得多，因此可能被低估。因此，目前尚不清楚非流感和非SARS-CoV-2病毒在成人CAP中的贡献程度、多重病毒检测的频率以及哪些患者特征与病毒检测和多重病毒阳性相关[3]。
多重呼吸道病原体检测有助于解决这一诊断缺口。在日本，FilmArray Respiratory Panel（BioFire Diagnostics，美国盐湖城）于2019年上市，能够同时检测多种呼吸道病毒。我们医院于2023年引入了FilmArray Respiratory Panel 2.1，可以在常规实践中检测六种目标病毒：腺病毒、季节性冠状病毒、人类偏肺病毒（hMPV）、副流感病毒（PIV）、呼吸道合胞病毒（RSV）和人类鼻病毒/肠道病毒（HRV/EV）。
全面的呼吸道病毒检测具有几个重要的临床意义。首先，它能够识别在常规诊断中可能被遗漏的病毒病原体。其次，它提供了关于多重病毒检测频率及其相关临床特征的见解，这一发现往往难以解释。第三，当结果在临床早期获得时，它们可以支持病因评估、指导抗生素选择并指导适当的感染控制措施。
基于上述背景，我们旨在描述我们医院对通过影像学确诊为肺炎的门诊患者进行的多重PCR检测中这六种目标病毒（腺病毒、季节性冠状病毒、hMPV、PIV、RSV和HRV/EV）的检测模式。具体来说，我们（1）描述了检测到的病毒分布，（2）总结了每月的趋势并评估了不同月份的病毒分布差异，（3）比较了单病毒阳性病例与多重病毒阳性病例之间的患者特征差异以及与多重病毒阳性相关的因素。
章节片段
伦理批准
该研究方案获得了东京罗斯爱医院伦理审查委员会的批准（批准编号07-28，2026年2月20日）。所有程序均按照《赫尔辛基宣言》及其后续修订版进行。由于本研究为回顾性观察性研究且使用了去标识化数据，因此无需书面知情同意。相反，患者可以通过公开研究信息来选择不参与。
结果
共进行了834次FilmArray Respiratory Panel 2.1检测，部分患者接受了重复检测。其中，199次检测对至少一种目标病毒（腺病毒、季节性冠状病毒、hMPV、PIV、RSV和HRV/EV）呈阳性。在199次阳性检测中，161例通过影像学确诊为肺炎。在这161例病毒阳性肺炎病例中，只有2例（1.2%）仅通过胸部X光片确诊。在161例病毒阳性肺炎检测中，116例（72.0%）需要住院治疗。
讨论
多重呼吸道病毒检测在成人CAP中的应用日益增多，但临床医生通常需要背景信息来解释常规实践中获得的阳性结果。在这项针对影像学确诊为肺炎的门诊患者的研究中，我们描述了通过常规多重PCR检测到的六种非流感和非SARS-CoV-2呼吸道病毒的分布情况。HRV/EV是最常检测到的病毒，其检测分布存在月度差异。多重病毒阳性较为罕见
结论
在门诊环境中评估的影像学确诊为肺炎的成人患者中，通过常规多重检测发现了非流感和非SARS-CoV-2呼吸道病毒，其中HRV/EV最为常见。病毒分布存在月度差异，多重病毒阳性较为罕见，并且与较年轻的年龄相关。这些发现支持了常规多重检测在描述成人肺炎中病毒检测实际模式中的作用。然而，上
作者贡献
TM是首席研究员，负责研究的整体组织和协调。所有作者都参与了数据收集。TM进行了统计分析并主导了数据解读。TM、KI、HM、KK、SH、ES和MK对研究的构思和设计做出了重要贡献。TM起草了原始手稿。所有作者都对手稿的重要内容进行了严格审阅。MK提供了高级监督和关键指导
手稿准备过程中生成式AI和AI辅助技术的声明
在准备这项工作时，作者使用了基于AI的语言模型（ChatGPT）来辅助英语编辑并提高清晰度。使用该工具后，作者根据需要审查和编辑了内容，并对发表文章的内容负全责。
资金
本研究未获得公共、商业或非营利部门的任何特定资助。
