优化DNA提取和定量PCR方法,以实现高效、精确地检测水样和海洋沉积物中的有毒甲藻Karenia brevis
《Harmful Algae》:Optimizing DNA extraction and quantitative PCR protocols for the efficient and precise quantification of the toxic dinoflagellate Karenia brevis in water and marine sediments
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时间:2026年05月16日
来源:Harmful Algae 4.5
编辑推荐:
Michelle R. Gaither | Julie A. Koester | Mousumi Akter Mary | Zain Khalid | Girish Kumar | Yida Gao | Aspen Oudshoorn | Alicia E. Hoeglund |
Michelle R. Gaither | Julie A. Koester | Mousumi Akter Mary | Zain Khalid | Girish Kumar | Yida Gao | Aspen Oudshoorn | Alicia E. Hoeglund | Charles L. Tilney | Katherine A. Hubbard
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不同的提取方法适用于过滤物和沉积物。
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qPCR检测的检出限(LOD)为7.4个拷贝/反应,定量限(LOQ)为641个拷贝/反应。
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将qPCR检测技术扩展到ddPCR可以实现目标遗传标记的绝对定量。
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在沉积物中检测到的阳性结果可能与近期发生的有害藻华(HAB)事件相关。
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该研究首次在沉积物中检测到了K. brevis的DNA。
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