优化DNA提取和定量PCR方法,以实现高效、精确地检测水样和海洋沉积物中的有毒甲藻Karenia brevis

《Harmful Algae》:Optimizing DNA extraction and quantitative PCR protocols for the efficient and precise quantification of the toxic dinoflagellate Karenia brevis in water and marine sediments

【字体: 时间:2026年05月16日 来源:Harmful Algae 4.5

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  Michelle R. Gaither | Julie A. Koester | Mousumi Akter Mary | Zain Khalid | Girish Kumar | Yida Gao | Aspen Oudshoorn | Alicia E. Hoeglund |

Michelle R. Gaither | Julie A. Koester | Mousumi Akter Mary | Zain Khalid | Girish Kumar | Yida Gao | Aspen Oudshoorn | Alicia E. Hoeglund | Charles L. Tilney | Katherine A. Hubbard
  • 不同的提取方法适用于过滤物和沉积物。
  • qPCR检测的检出限(LOD)为7.4个拷贝/反应,定量限(LOQ)为641个拷贝/反应。
  • 将qPCR检测技术扩展到ddPCR可以实现目标遗传标记的绝对定量。
  • 在沉积物中检测到的阳性结果可能与近期发生的有害藻华(HAB)事件相关。
  • 该研究首次在沉积物中检测到了K. brevis的DNA。

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