整合生物信息学和机器学习研究发现，LTF（某种蛋白质）与MMP8（另一种蛋白质）与全身性炎症和肺损伤之间存在关联

《Respiratory Research》：Integrative bioinformatics and machine learning reveal an association of LTF and MMP8 with systemic inflammation and lung injury

【字体：大中小】 时间：2026年05月17日 来源：Respiratory Research 5

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　　摘要背景急性肺损伤及其严重形式——急性呼吸窘迫综合征（ARDS）是危及生命的疾病，具有较高的死亡率。由于肺是败血症等全身性炎症反应的主要靶器官，本研究旨在通过分析与全身性炎症相关的转录组数据来识别关键调控基因，并探讨这些基因在肺损伤中的作用。方法我们对GSE32707数据集（全身

摘要

背景

急性肺损伤及其严重形式——急性呼吸窘迫综合征（ARDS）是危及生命的疾病，具有较高的死亡率。由于肺是败血症等全身性炎症反应的主要靶器官，本研究旨在通过分析与全身性炎症相关的转录组数据来识别关键调控基因，并探讨这些基因在肺损伤中的作用。

方法

我们对GSE32707数据集（全身性炎症患者与对照组）进行了生物信息学筛选，使用了差异表达分析、WGCNA和机器学习方法。同时进行了功能富集分析、蛋白质相互作用网络（PPI）分析、免疫细胞浸润分析、ceRNA网络分析以及分子对接分析。验证工作通过人类样本、细胞实验和小鼠肺损伤模型来完成。

结果

我们发现了506个差异表达基因，这些基因主要富集在与免疫相关的通路中。机器学习算法将乳铁蛋白（LTF）和基质金属蛋白酶-8（MMP8）确定为关键基因。共免疫沉淀（Co-IP）实验表明LTF和MMP8之间存在物理关联。预测的ceRNA网络提示LTF存在转录后调控作用，而分子对接分析显示LTF/MMP8与甲基泼尼松龙具有结合潜力。实验验证证实，这两种基因在肺损伤期间表达上调，并且可以通过抗炎治疗进行调控。

结论

乳铁蛋白（LTF）和基质金属蛋白酶-8（MMP8）在肺损伤中起着关键作用，可能作为全身性炎症与肺损伤之间的分子连接器，是进一步研究的有希望的治疗靶点。

背景

急性肺损伤及其严重形式——急性呼吸窘迫综合征（ARDS）是危及生命的疾病，具有较高的死亡率。由于肺是败血症等全身性炎症反应的主要靶器官，本研究旨在通过分析与全身性炎症相关的转录组数据来识别关键调控基因，并探讨这些基因在肺损伤中的作用。

方法

我们对GSE32707数据集（全身性炎症患者与对照组）进行了生物信息学筛选，使用了差异表达分析、WGCNA和机器学习方法。同时进行了功能富集分析、蛋白质相互作用网络（PPI）分析、免疫细胞浸润分析、ceRNA网络分析以及分子对接分析。验证工作通过人类样本、细胞实验和小鼠肺损伤模型来完成。

结果

我们发现了506个差异表达基因，这些基因主要富集在与免疫相关的通路中。机器学习算法将乳铁蛋白（LTF）和基质金属蛋白酶-8（MMP8）确定为关键基因。共免疫沉淀（Co-IP）实验表明LTF和MMP8之间存在物理关联。预测的ceRNA网络提示LTF存在转录后调控作用，而分子对接分析显示LTF/MMP8与甲基泼尼松龙具有结合潜力。实验验证证实，这两种基因在肺损伤期间表达上调，并且可以通过抗炎治疗进行调控。