社区中的“枯枝朽木”（指无用或废弃的实体）以及庭院的野外化改造措施，能够调节城市居民体内的共生微生物群和炎症信号

《Microbiome》：Neighborhood deadwood and yard rewilding modulate commensal microbiomes and inflammatory signals among urbanites

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摘要

背景

城市化和生物多样性的丧失减少了人类接触多样微生物群的机会。现有证据表明，工业化人群中逐渐消失的微生物群是非传染性免疫介导疾病发病率上升的一个核心因素。人们提出“重新野化”（rewilding）作为一种方法，旨在丰富城市微生物群落并增强免疫系统的韧性。

结果

我们在21个城市私人庭院中引入了枯木、植被和富含微生物的土壤。同时设立了15个对照庭院作为对比。我们分析了皮肤细菌和口腔微生物群，并通过植被与枯木清单、卫星数据以及问卷调查，来研究重新野化、生活环境和生活方式对皮肤和口腔微生物群、功能基因通路以及细胞因子水平（IL-6、IL-10）的影响。以家庭庭院周围200米范围内的枯木数量作为环境生物多样性的指标。样本分别在重新野化前的夏季和三个月后的秋季采集。

尽管秋季有正常的季节性下降以及户外活动时间的减少，重新野化组的皮肤微生物多样性保持稳定，并且与植物丰富度相关。重新野化还与tetrahydrofolate生物合成和代谢途径以及L-组氨酸降解基因通路的变化有关。在秋季，重新野化组中，采摘浆果和水果的行为与唾液中具有免疫调节作用的IL-10和多效性IL-6直接相关；而社区内的枯木数量则与口腔微生物群中的脂肪酸生物合成超途径相关。当两个组一起分析时，口腔微生物功能基因途径的多样性与IL-6水平呈负相关，社区内的枯木数量与唾液中的Gamma-变形菌门（Gammaproteobacteria）分类群以及通常来自土壤的Cytobacillus sp. CY-G和Streptomyces sp. HSG2种类直接相关。

结论

我们的研究结果支持生物多样性假说，即接触生物多样性可能会影响共生微生物群以及宿主-微生物相互作用所涉及的生物通路。我们的研究表明，除了传统的绿色度和植被多样性指标外，社区内腐烂枯木的数量也可能为研究人类-环境微生物群相互作用提供有价值的信息。这有助于了解与人类健康相关的生物多样性相关生态系统服务。

我们的发现为未来研究和支持地球健康而重新野化城市微生物群的战略投资提供了动力。

视频摘要

背景

城市化和生物多样性的丧失减少了人类接触多样微生物群的机会。现有证据表明，工业化人群中逐渐消失的微生物群是非传染性免疫介导疾病发病率上升的一个核心因素。人们提出“重新野化”作为一种方法，旨在丰富城市微生物群落并增强免疫系统的韧性。

结果

我们在21个城市私人庭院中引入了枯木、植被和富含微生物的土壤。同时设立了15个对照庭院作为对比。我们分析了皮肤细菌和口腔微生物群，并通过植被与枯木清单、卫星数据以及问卷调查，来研究重新野化、生活环境和生活方式对皮肤和口腔微生物群、功能基因通路以及细胞因子水平（IL-6、IL-10）的影响。以家庭庭院周围200米范围内的枯木数量作为环境生物多样性的指标。样本分别在重新野化前的夏季和三个月后的秋季采集。

尽管秋季有正常的季节性下降以及户外活动时间的减少，重新野化组的皮肤微生物多样性保持稳定，并且与植物丰富度相关。重新野化还与tetrahydrofolate生物合成和代谢途径以及L-组氨酸降解基因通路的变化有关。在秋季，重新野化组中，采摘浆果和水果的行为与唾液中具有免疫调节作用的IL-10和多效性IL-6直接相关；而社区内的枯木数量则与口腔微生物群中的脂肪酸生物合成超途径相关。当两个组一起分析时，口腔微生物功能基因途径的多样性与IL-6水平呈负相关，社区内的枯木数量与唾液中的Gamma-变形菌门（Gammaproteobacteria）分类群以及通常来自土壤的Cytobacillus sp. CY-G和Streptomyces sp. HSG2种类直接相关。

结论

我们的研究结果支持生物多样性假说，即接触生物多样性可能会影响共生微生物群以及宿主-微生物相互作用所涉及的生物通路。我们的研究表明，除了传统的绿色度和植被多样性指标外，社区内腐烂枯木的数量也可能为研究人类-环境微生物群相互作用提供有价值的信息。这有助于了解与人类健康相关的生物多样性相关生态系统服务。

我们的发现为未来研究和支持地球健康而重新野化城市微生物群的战略投资提供了动力。

视频摘要

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