日本铺道蚁（Tetramorium tsushimae Emery，膜翅目：蚁科）本地种群的染色体级基因组组装

《Scientific Data》：A chromosome-level genome assembly of the native populations of the Japanese pavement ant, Tetramorium tsushimae Emery (Hymenoptera: Formicidae)

　　

摘要

日本铺道蚁（Tetramorium tsushimae Emery）是一种具有生态重要性的蚂蚁物种，以其与蚜虫及其他半翅目昆虫的互利共生关系而闻名。本文首次完成了该物种的染色体级基因组组装，采用了Oxford Nanopore长读长测序技术并结合Pore-C支架技术进行构建。最终获得的基因组序列长度为259.2 Mb，分布在13条染色体上，支架序列的平均长度（N50）为19.7 Mb。我们共鉴定出34,352个蛋白质编码基因，其中58.9%的基因获得了功能注释。该基因组中重复序列占比为21.58%，根据BUSCO分析其完整性达到98.4%。基因家族进化分析显示存在直系群扩张与收缩现象；与Cardiocondyla obscurior Wheeler的基因组对比发现，两者存在广泛的序列一致性，同时也存在与物种演化相关的重排结构。这一高质量的基因组组装为未来研究的进化过程、生态特征及社会行为提供了宝贵的基础。