在肝脏再生过程中，胆管细胞向未成熟肝细胞分化过程中lncRNA、miRNA和mRNA的动态变化

《Scientific Data》：lncRNA, miRNA, and mRNA dynamics in cholangiocyte-to-immature hepatocyte differentiation in liver regeneration

摘要

非编码RNA在肝脏再生过程中发挥着重要作用，但它们在胆管细胞向肝细胞分化中的作用仍不清楚。新兴的肝脏导管类器官为模拟体内胆管细胞向未成熟肝细胞转化的分子机制提供了强大的模型，有望加速肝脏再生医学的发展。在本研究中，我们从三只C57BL/6小鼠中建立了肝脏导管类器官，并诱导胆管细胞分化为未成熟肝细胞，进而进行转录组测序。随后，我们分析了扩增培养基（EM）和分化培养基（DM）样本中lncRNA、miRNA及mRNA的表达谱。通过严格的筛选，共获得了6个RNA-seq文库和6个miRNA-seq文库生成的529,049,578条和61,266,130条有效读段。最终鉴定出24,676个lncRNA、1,018个miRNA以及38,689个mRNA转录本。该数据集将有助于阐明肝脏再生过程中胆管细胞向未成熟肝细胞分化的相关分子机制，并为肝脏再生医学的研究提供线索。