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摘要
肌肉浸润性膀胱癌(MIBC)在临床上具有异质性,目前的分子分型方法无法准确反映肿瘤状态的空间组织结构和微环境特征。在此研究中,我们通过整合22个肿瘤的空间转录组数据以及相应的RNA测序和全外显子测序数据,构建了一个MIBC的空间图谱。我们发现,在单个肿瘤内部存在一个连续的、空间上有序的从管腔到基底的轴线,该轴线与较高的染色体不稳定性和转录可塑性相关。管腔区域的肿瘤细胞富含FGFR3和NECTIN4蛋白,而基底样细胞则主要分布在肿瘤的侵袭边缘,这些细胞与EGFR信号通路激活、上皮-间充质转化、基因组不稳定、免疫细胞浸润以及更高的化疗敏感性相关。空间分析还揭示了不同细胞谱系和位置在三级淋巴组织结构上的差异。对超过3000个肿瘤的群体分析证实了FGFR3和EGFR谱系的特异性以及相关的免疫反应模式。这些发现共同构成了一个空间框架,有助于理解MIBC中的细胞谱系状态、免疫机制和治疗敏感性。


