2023–2024年河南省新出现的猪圆环病毒3型的流行病学和遗传变异分析

《BMC Veterinary Research》：Epidemiological and genetic variation analysis of emerging porcine circovirus type 3 in Henan Province, 2023–2024

　　

摘要

背景

猪圆环病毒3型（PCV3）是一种具有高度遗传变异性的新兴病原体，对猪的健康和疾病控制构成了持续挑战。病毒的持续进化凸显了进行分子监测以监控流行中的PCV3菌株的必要性。

结果

2023年至2024年间，中国河南省收集了257份患有生殖和呼吸系统疾病的猪的血液和组织样本。通过定量实时PCR（qPCR）检测，21.79%（56/257）的样本中检测到了PCV3。对15种新的PCV3菌株进行基因鉴定后发现，这些菌株之间的核苷酸（nt）同一性为98.95–99.95%，与全球参考菌株的同一性为98.70-99.85%。对ORF2基因的系统发育分析确定了PCV3a-1、PCV3a-2、PCV3a-IM、PCV3b和PCV3c亚型，其中PCV3b占主导地位。值得注意的是，一种基因上存在差异的菌株HN240609被归类在PCV3c亚组中。此外，在衣壳（Cap）蛋白的预测T细胞和B细胞表位区域观察到了多个独特的氨基酸（aa）突变（R10K、A35V、T102A、T102S、F104Y、T170A和V180I）。

结论

河南省同时存在遗传多样化的PCV3菌株，衣壳蛋白抗原区域的突变可能有助于病毒逃避免疫反应。因此，持续的分子监测对于有效预防和控制PCV3至关重要。